近未来的东京，有着一个为了夺取“最强武器”而建立的两大组织，以开发最强兵器为目的的导示重工，和通过操控遗传因子来制造优秀人类的NSWF。他们的共同目的只有一个，就是得到那个拥有着最强威力、并且只有通过被选中的女人才能操纵的终极武器“WITCHBLADE”。地震灾害的6年之后……天羽雅音、梨穂子 ，两人幸福的生活着，但是，等待着她们的却是，WITCHBLADE那暗之力的召唤，以及异常残酷的命运……
观束总二（岛崎信长 配音）是一位各方面看来都十分平凡的高中男生，要说唯一的不同，那就是他对于双马尾发型有着超乎常人的热爱和执念。某日，一位名叫朵艾儿（内田真礼 配音）的神秘女子突然出现在总二的面前，来自异世界的她的出现彻底改变了总二的一生。城镇之中忽然出现了大量来自异世界的怪物，彻底搅乱了人们平静的而生活，朵艾儿赋予了总二变身的力量，总二变身成为了红马尾战士（上坂堇 配音），展开了和异形的殊死搏斗。随着时间的推移，津边爱香（相坂优歌 配音）变身的蓝尾战士，神堂慧理那（赤崎千夏 配音）变身的黄尾战士，依丝娜（日笠阳子 配音）变身的黑尾战士纷纷加入战局。
作为一部定格动画打出的口号是“战争、谋杀、正面全裸”，讲述霍尔特配音的善良农民Patrick在皇家城堡里找到了一份人人羡慕的侍卫工作，但美差很快变成了噩梦：他发现自己热爱的王国已经被好色的君主、骗子、小人所统治。更惨的是，全家最正气英勇的Patrick被家人看成害群之马，他那恶贯满盈的兄弟手足们来找麻烦了。
