人类殖民星球遭到外星人库克托尼亚人的袭击，守护驻军被消灭，留下 13 名儿童。故事讲述他们乘坐地球军事训练舰“Janus”号，与使用名为“Roundburnians”的人形武器的外星人作战，以拯救被外星人俘虏的家人和朋友。故事根据儒勒·凡尔纳的小说《两年假期》（男生称之为“两年假期”）改编。宇宙版《少年的假期》的构思是在《机动战士高达》的企划过程中产生的，但随着《高达》走向了不同的方向，本作是以此为主题的新动画，因此富野由悠季的名字被冠以“原作作者”之名。
灵气复苏，整个世界都被浓郁的灵气所覆盖，地球上的生物被此影响。人类开始觉醒，拥有更强的力量。人类以外的生物同样在灵气影响下飞速进化。
魔王终于被勇者打倒，世界恢复了从前的宁静，这样宁静的日子，一过就是15年。这一天，一位名叫风色琴音（井上穗乃花 配音）的女孩孤身一人来到上京，她的目的地，是一间名叫RPG的不动产中介，她要在这里工作。性格天真烂漫，能够和亚人交流的弗雅（木野日菜 配音）、以成为神官为梦想而努力着的，表面看起来有些严厉，实际上内心非常可爱的露芙莉娅（川井田夏海 配音）、身为战士时所向披靡，可在不动产的工作能力却堪忧的拉琪拉（石见舞菜香 配音），等待着琴音到来的，是这些可靠又古灵精怪的前辈们。
2300年前，拥有最高圣舞法结界的圣舞场，被混舞族的萨利将军偷袭成功，被占领最高舞法结界的圣舞族立刻陷入恐慌，因为只要持续365天，圣舞场就会彻底崩塌毁灭。圣女王将带回炫彩舞光和璀璨战舞的任务，交给碧巧和紫萱圣女。圣舞族希望借助天女们的舞法能量修复被毁坏的圣舞场。另一方面，受混乱将军指使，卤渣和甘草也来到现代世界阻止两圣女找寻天女们，并协同人类世界的混族狂澜释放捣蛋玩偶使城市陷入噩梦的笼罩。 三天女从开始的矛盾到互相信任，互帮互助共同解决捣蛋玩偶，不断成长。而混徒趁机释放噩梦种子，让整座城市陷入噩梦之中。面对危机，三天女能否战胜自我，合力对抗混徒的阴谋，解除噩梦危机让城市恢复到和平之中？
现代忍者的故事。
