人类殖民星球遭到外星人库克托尼亚人的袭击，守护驻军被消灭，留下 13 名儿童。故事讲述他们乘坐地球军事训练舰“Janus”号，与使用名为“Roundburnians”的人形武器的外星人作战，以拯救被外星人俘虏的家人和朋友。故事根据儒勒·凡尔纳的小说《两年假期》（男生称之为“两年假期”）改编。宇宙版《少年的假期》的构思是在《机动战士高达》的企划过程中产生的，但随着《高达》走向了不同的方向，本作是以此为主题的新动画，因此富野由悠季的名字被冠以“原作作者”之名。
在全宿舍制的切里顿学园里，羊驼提姆被什么人吃了。在肉食兽和草食兽共存的世界中，这是最大的禁忌，也是无法超越的种族的墙壁。这是大灰狼雷格西（17岁）和各种各样的动物交织在一起，激烈的、悲伤的青春群像剧！
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