《神探狄仁杰3》分为《凉州案-黑衣社》和《邗沟案-漕渠魅影》两个惊险绝伦、触目惊心的故事组成。故事承接第二部，狄仁杰（梁冠华饰）自连破幽州、并州、蛇灵、江州等一系列大案后，几经恳请，终于得武皇（吕中饰）允准回老家并州修养。然而就像护卫李元芳（张子健饰）所言，这看似颐养天年的平静中却蕴藏着更大的杀机与阴谋。
1949年后，陕甘宁地区特别是甘肃地区虽已解放，但国民党残余势力领导者章世光坚持“抗拒起义，忠于总统”，纠集散兵游勇惯匪与当地土匪勾结，组织成一支势力强大的土匪武装，与原本就活跃在周边的数股悍匪相互勾结，杀害区、乡基层干部,抢劫人民财物,进行反动宣传,成为新中国的一大害。中共西北局和西北军区发出的剿匪工作指示，派出以周正阳和黄一飞为首的革命战士组成了一支英勇无敌的“擒狼队”前往围剿，力挽狂澜，打了一场场漂亮的伏击战，全歼了陕甘宁地区的土匪，为稳定西北局势做出了不朽的贡献。
该作品是根据松本二郎的漫画《一击》改编的青春动作剧，改编自小说《幕末一击必杀队》。故事讲述了江户时代末期，为了应对自称为帝国浪人和武士的盗窃行为，由农民组成的特殊作战部队“一护必杀队”的活动。曾在江户掀起轩然大波的萨摩藩。
该剧是一部梦想成为现代版林尚玉的女子龙秀晶（严贤京 饰）与绝症患者吕义柱（徐俊英 饰）相遇，两人开展了一段从摇篮到坟墓的浪漫复仇故事。
38岁的精神科医生苏珊娜·奥雷斯特两年后重返皇家山研究所，治疗重症患者。她那神秘的疾病并没有让她退缩，反而让她在人生最黑暗的角落里找到了光明。
