《铁齿铜牙纪晓岚3》由“好女争锋”、“假作真来真亦假”、“江湖江湖”、“辨奸计”和“胭脂红”五个单元故事组成。故事由神秘的江南女子陆琳琅（张庭饰）的出现而变得一波不平一波又起。陆姑娘深受乾隆（张铁林饰）宠爱，暂住纪晓岚（张国立饰）府上。然而和珅（王刚饰）早知陆姑娘身世， 为斩草除根，多番设计陷害陆姑娘。幸得纪晓岚解救，并一洗陆家冤情。然而这三个老男人却都陷入了儿女情长的重重矛盾中，本不平静的京城更是风波不断。
该剧讲述一对双胞胎姐妹刚出生便被迫分离，不同的成长环境造就了两人迥异的性格，巧合的是，长大后两人却爱上了同一个人，上演了一出纠结的三角恋情。
东海市公安局特警支队，有一支独特的女子特战小组，代号霹雳，六名队员都是精挑细选出来的女警官。她们隶属于特警支队一大队——闪电突击队，来自五湖四海，性格迥异，却都怀抱着一个女特警的英雄梦。突击队长彭鹰洋，是一名优秀的特警警官，他时时刻刻关注着霹雳特战小组的成长。在训练和工作当中，他都是高标准严要求，因此导致女队员们的不满，甚至导致抗争。一个偶然的机会，特战小组组长程菡玥得知，彭鹰洋的女朋友是一名女刑警，牺牲在缉毒行动当中，她们才明白，彭鹰洋对她们严格的用意。霹雳女子特战小组成长起来，在一系列的恶性处突行动当中，表现优异，绽放出警界铿锵玫瑰的独特风采。
圣灵族青女商幼（钟丽丽 饰）在大婚前夕意外救下冥族的冥王司渊（管栎 饰），却不想新婚当日全族被灭。为了复活族人，商幼伪装成鹿妖梦狸来到冥族夺取冥王的琥珀心，在相处中商幼竟爱上了自己的仇人，但为了复活族人商幼还是选择挖出司渊的心，最终却发现仇人另有其人……
嫁到马来西亚做大嫂的李梦露身负巨债，逼不得已投靠姪女李乐怡，二人性格南辕北辙，不时发生龃龉。二人意外得知亲兄本有一档果栏，被冯大坚及其养子冯宝私侵，为要抢回业权，展开一连串软硬兼备的攻势，闹出不少笑话与风波。乐怡同窗黄友财是油麻地热心社工，邂逅酒吧奇女子陈玉敏且纠缠于果栏与江湖是非之间。梦露、乐怡及玉敏三女子多番经历，令到本来属于男人世界、守旧缺乏朝气的果栏，起了翻天覆地的变化，打拼出一片新天地。
2004年宁夏某矿区小镇面临动迁，一具被焚烧的女尸出现在警局门前，死状和10年前当地发生的一起恶性未结案件极为相似，即将退休老刑警褚志强和因工作过失被下调到矿区刑侦队的张韬成为同事，合力侦破案件，在小镇动迁的同时也揭开了过往留下的悲剧真相 。
纪小行（杜雨宸 饰）虽然渴望成为一名演员，无奈患有失语症，无法在镜头前面开口说话，她只能在各个电影里扮演没有台词的龙套角色。一次偶然中，纪小行遇见了名为舒湛（李汶翰 饰）的偶像歌手，两人一起被卷入了某件神秘事件之中。
阿纯（林家栋 饰）是村里有名的“野孩子”，母亲疯疯癫癫，父亲不知所踪。大酒坊“九铺香”的当家古世龙（秦沛 饰）可怜阿纯坎坷的遭遇，收留了他，为了报答古世龙的救命之恩，阿纯在酒坊之中尽心尽责，勤勤恳恳，但却因为不光彩的身世而饱受欺凌和非议。
