《铁齿铜牙纪晓岚3》由“好女争锋”、“假作真来真亦假”、“江湖江湖”、“辨奸计”和“胭脂红”五个单元故事组成。故事由神秘的江南女子陆琳琅（张庭饰）的出现而变得一波不平一波又起。陆姑娘深受乾隆（张铁林饰）宠爱，暂住纪晓岚（张国立饰）府上。然而和珅（王刚饰）早知陆姑娘身世， 为斩草除根，多番设计陷害陆姑娘。幸得纪晓岚解救，并一洗陆家冤情。然而这三个老男人却都陷入了儿女情长的重重矛盾中，本不平静的京城更是风波不断。
CMFU是中国最神奇大学，在CMFU学院的太极系因多年的派系之争而逐渐没落。热爱太极文化的风飘飘（女主）立志 报考太极系，却因卫楚（男主）错过了考试，勉强进入文学院的书画系学习。在卫楚和风飘飘的努力下，太极系一步一步走向复兴，吸引了越来越多的学生加入。风飘飘和卫楚这对欢喜冤家，也从相看两厌发展到彼此欣赏。
梁冠华在剧中饰演的角色是抗战时期新四军武工队最英勇善战的猎狼部队队长梁本初，绰号“龙王”，在他的带领下，“猎狼人”与日军斗智斗勇，取得了一次次的胜利，同时他也改变了剧中另外几个人一生的命运，算得上是一个带路的先知。卫小雨饰演的钟宁是一个从小立志为父报仇的刚烈女子。机遇巧合下，钟宁认识了梁冠华饰演的“龙王”，并拜他为师，在与老梁的接触中，钟宁学会了很多也明白了很多，最终成为猎狼人部队搏杀日寇的一名优秀战士。韩童生饰演黑帮老大陈枫仁，他为了自己的利益不择手段，甚至不惜以人质为交换利用猎狼人。在被猎狼人击败后，他又为了利益投靠了日军。黄海冰饰演的“李学武”是钟宁父亲的副官，一直保护着钟宁，最后，李学武更是为了守护钟宁而牺牲。张笑君扮演的西田是一个阴险狡诈，心狠手辣的狠角色，也是“猎狼人”的天敌。
东北地方军阀陆振华（寇振海 饰）因“九一八”事变而带着一家老小逃亡至上海，定居于法租界。生性温柔的八姨太文佩母女（徐幸 饰）被霸道专横的九姨太雪琴（王琳 饰）赶走，就连忠心耿耿的李副官（曹秋根 饰）一家也无法幸免。至此被赶走的两家人生活十分艰苦，文佩女儿依萍每次上门找父亲要生活费，都会被雪琴奚落一番，生性倔强的依萍与雪琴发生冲突，结果遭父亲鞭打，依萍自此对父亲家埋下怨恨。被赶后的李副官也只能拉黄包车过活，女儿可云（徐路 饰）又换上了精神病，李副官前来向文佩求救，但文佩一家也拮据得爱莫能助。这时，依萍为了生活，决定到歌舞厅当歌女。不久她认识了到歌厅采访的记者何书桓（古巨基 饰），当得知她是雪琴为女儿如萍（林心如 饰）介绍的男友时，顿生夺爱的念头。怎料在交往的过程中，依萍与书桓相爱了。但其实书桓的朋友杜飞（苏有朋 饰）悄悄爱上了如萍，正当如萍因失去了书桓，杜飞便采取了猛烈的追求，但如萍却只接受了他的友谊，杜飞却继续竭而不舍。当依萍的哥哥尔豪（高欣 饰）爱上了同是依萍好友的方瑜（李欣 饰）相爱后，才知道原来可云的病，是因为当年可云怀上了尔豪的孩子，孩子因病死后，可云就变得疯疯癫癫的。众人决定为可云找回原来的记忆，恢复原来的样子。一段断儿女情长，姐妹恩怨，又能否在一起经历的事情中得到化解呢？
李鸦儿（程宇峰 饰）替父接亲当晚新娘离奇自焚，自己也被刺客袭击失忆沦落为奴。当血色谜团撞破身世秘密，虐恋主仆被迫刀剑相向。面具之下暗藏真心，诡案背后涌动深情，看双面郡主如何携手冷面杀神，在大唐暗夜中破局守江山！
实习捕快苏小翘为了调查母亲被灭口的线索，与清风寨匪首遗孀顾青黛互换身份和面容，在清风寨当起了寨主，并以顾青黛的身份“娶”了前来卧底的肃正阁上司楚晏为压寨夫君，以探究其阴谋背后的真相。
1949年，国民党在大陆的政权轰然倒塌，其残部纷纷撤入台湾。为取得全国的解放，共产党第三野战军继续向南挺进。王本利（尤勇 饰）所在的独立师红六团是这次作战的主力，然而由于海上作战经验和一支正规海军的缺乏，红六团九千多名官兵全部葬身海底。侥幸活下来的王本利为不忘这段惨痛的历史，以好友的名字更名为王山魁。抗美援朝胜利后，王山魁被新组建的海军政委卢信泉（杜志国 饰）调至麾下，正式从一名陆军军官转变为海军副司令。在此期间，他与美丽的女军医许锦云（郑卫莉 饰）结为夫妇，还卧薪尝胆钻研对抗国军千吨级战舰的刺刀战，并成功地以几艘驱逐舰和鱼雷舰击沉敌人的千吨级战舰“荆门号”和“樟江号”，为当年红六团的战友一血前耻。在接下来的几十年里，这位铁骨铮铮的汉子随新中国经历了无数的荣誉和磨难……
