随着和平的到来而走向近代化的木叶忍者村。高楼林立，巨大显示屏中播放出影像，连结各区域的电车在村里奔驰。虽说是忍者村，但一般民众也增多，忍者的生存方式也在逐渐改变的这个时代——村子的领袖，第七代火影·漩涡鸣人的儿子慕留人，进入了培育忍者的学校“忍者学校”。周围的学生们带着“火影的儿子”这样偏见的目光看待慕留人，但慕留人凭借天生的破天荒性格将这种小事轻松越过！慕留人与新的伙伴相遇，他将如何挑战突然发生的神秘事件？在众人心中如疾风般狂奔的“漩涡慕留人”的物语，现在开始！！
魔法——這不是傳說或童話的產物，而是發展至今將近一個世紀的現實技術。今年春天，持有施展魔法能力的「魔法師」培育機構「魔法科高中」，某位少女將入學就讀。容貌秀麗、完美無缺的優等生——她的名字叫「司波深雪」。深雪夢想著和一同入學的哥哥——達也過著親密的高中生活，但擋在她面前的是一科生與二科生——優等生與劣等生的高牆……!? 由愛慕哥哥之心更勝親情的妹妹——深雪的視角所鮮活描繪的，另一個「魔法科高中」在此上演。
与七大不可思议中的第七号、“厕所的花子”中的花子君结下不解之缘的少女：八寻宁宁。驱魔师一族的少年：源光。两人与花子君一起，为了将发生异变的七大不可思议以及怪异的传闻恢复原状，每日奔忙不停。忽一日，花子君说道：七大不可思议中出了背叛者。宁宁等人为了找出背叛者，开始逐一摧毁七大不可思议的依附物。他们已经摧毁了第二号“岬的楼梯”以及第五号“16时的书库”，剩下包括“厕所的花子”在内的五个…而在暗中，花子君的弟弟司，召集了七峰樱、日向夏彦、以及新成为七大不可思议第三号“镜地狱”的三叶，接近了宁宁等人尚未找到的七大不可思议……
兮子唐的故事是一个平凡少年踏上修仙之路的典型故事，然而，他所处的时代和环境却并不容易。太子生不逢时，国家危机四伏，他只能在边陲小镇与乳母度过童年。然而，乳母的期望和培养让他心怀复国大志，取名兮子唐，寓意家国情怀。送到垂云山修炼后，兮子唐经历了十年的修炼，终于突破了武境，踏入了仙境。然而，他的修为虽然提升，但在现实中，他仍然是一个弱小的凡人，甚至凡仙下等的修为在这个修仙者遍地的世界里也显得微不足道。面对现实的残酷，兮子唐并没有沮丧，而是以初生牛犊不怕虎的冲劲儿出山，立誓要吊打八仙，铲平蓬莱解放四洲还天下太平。他的志向和勇气让人为之折服，但也面临着重重困难和挑战。在这个充满修仙者的江湖中，兮子唐要想掀起血雨腥风，必须要有过人的智慧、勇气和实力。他或许会遭遇各种阻碍和挑战，但正是在这样的磨砺中，他才有可能成长为一个真正的大侠，书写属于自己的传奇。
