《灵剑尊》是由索以文化制作的3D动画。根据同名小说《灵剑尊》和漫画《灵剑尊》改编。该动画讲述了落魄少年楚行云立志要改变现状奋发图强创造一片新天地的故事大梦一场，落魄少年立志要改变现状奋发图强创造一片新天地。珍奇异宝，功法武决，遗失的强者洞府，在这个天才辈出，充满挑战和机缘的时代，且看落魄少主如何闯荡大陆、遭奇遇，成为叱咤风云的至尊天帝。以前的仇人，现在，绝不会放过！梦中的遗憾，现在，一定要弥补！待到灵剑长啸之时，天地三界，我为至尊！
伏魔三劍俠打敗了基比爾，阻止了惡魔族侵略地面。但由於大魔王加爾巴的詛咒，令三人永遠被封閉於一個膠囊之中。其後出現了更凶惡的妖怪軍團，飽受妖怪バックベアード困擾的主角月村圭接受了妖怪研究專家大馬博士（ダイマ博士）的七星壇儀式，使全宇宙最明亮光耀的破軍星降臨到地上，而破軍星當中就包含著三劍俠的魂魄。月村圭承繼了佐比丹的魂魄，成為了超越神的戰士超神Bibyun（超神ビビューン），而他的同學菅一郎及渡部剛，亦分別承繼了伊比路及加貝拉的魂魄，成為了超神Basharn（超神バシャーン）及超神Zshen（超神ズシーン）三位超神為了大地的和平及正義，決心與由大魔王加爾巴控制的妖怪軍團對抗到底。
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一场全球性地质灾难使得大陆处于割据状态，由不同的武装集团占领。大陆相对繁荣的萨科城被优人军阀攻占，萨科城北部为北域，西部为西庭，还有其周边五大城市原住民联合组织的五城联军，多方各自为政。由贺将带领的东邦小队与优人正面对抗，引起了多地势力的注意。与此同时，各地冲突不断升级，贺将被迫卷入激烈的斗争中。
故事发生在一个虚构的世界之中，在这里，突然之间出现了古代王朝遗迹群，人们称之为“迷宫”。在迷宫里，隐藏着数之不尽的宝物，而其中最为人津津乐道的，就是被称为“魔神金属器”的魔器。然而，想要得到这些宝物却并不是一件容易的事情，与之相伴的，是无处不在的危险和敌人。
