新干线超进化研究所为了从诞生于“漆黑新干线”的巨大怪物体手中守护日本的未来，人们开发了“新干线变形机器人SHINKALION”。具备与SHINKALION较高适合率的孩子们成为驾驶员，与研究所员齐心协力，面对强大的敌人！究竟“漆黑新干线”的目的是……。孩子们能否守护日本的未来……。变身！SHINKALION！
屯田林宪三郎，一名有妻有女、还有点宅的52岁公务员。某天，他在路上为了拯救小孩而被卡车撞到，失去意识，醒来时发现自己变成了金发纵卷的公爵千金·格蕾丝．奥弗涅的模样！看来自己成为了女儿在玩的女性向游戏《魔法学园爱＆魔兽》里登场的“反派千金”，宪三郎理解到自己遭遇到所谓的异世界转生。在那样的格蕾丝＝宪三郎的面前，游戏原本的主角安娜出现了……！？
无数细线横亘在星空之中，如同一把巨大的刷子。三体星舰队将于400年后抵达。遥远蝴蝶扇动着翅膀，也改变了罗辑的命运，轰然打开的门后是世界中心——面壁计划开启。同时，智子所创建的破壁室内，破壁人一一就位……
这一天，个性温柔的美少女万城目富美（高部爱 配音）即将开始崭新的高中的生活，此时，一个熟悉的身影出现在了她的视线中。名叫奥平明（仪部ゆう子 配音）的女孩，竟是富美分别了近十年的青梅竹马。这意外的相遇为久违的两人带来了小小的惊喜和快乐，而富美对小明的感情，也在相处的时日中渐渐明朗。爱哭的富美和活泼好动的小明，这一对性格迥异的好友能够终成眷属吗？同时，在外表成熟的井汲京子（堀江由衣 配音）的心中，学姐衫本恭己（石松千惠美 配音）的影子始终萦绕不散。在这所女子学校中，女孩子之间的感情，就像春天的野花，一点点的，逐渐的覆盖了荒芜的山脊。
