新干线超进化研究所为了从诞生于“漆黑新干线”的巨大怪物体手中守护日本的未来，人们开发了“新干线变形机器人SHINKALION”。具备与SHINKALION较高适合率的孩子们成为驾驶员，与研究所员齐心协力，面对强大的敌人！究竟“漆黑新干线”的目的是……。孩子们能否守护日本的未来……。变身！SHINKALION！
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本作动画改编自起点白金作者辰东遮天三部曲的第二部——完美世界。他为修道而生，为应劫而至，他身化亿万血雨，洒落万古岁月，经历无数时空的熬炼，岁月长河的洗礼，他化万古，他化自在。看男主石昊如何一生极致辉煌，造就无尽传说。
乐小宇、福星、立夏三人和神勇等五只钶龙历经万险集齐了核晶碎片，但邪恶的奥米伽吸收...
