故事设定在异兽入侵、全球变异的末世背景下，讲述青年明河因获得名为“神女”的灾星撞击，使原本被视为“垃圾”的超凡力与灾星融合，化作强大的“依附之灵”。他借此天赋逆袭，逐步成长为人类至强者并探索宇宙真相
我们不可能永远只是儿时好友──
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高中生夏目本来可以拥有平凡的高中生活，但是，他却能看到妖怪，并因此而苦恼。很多次，他都差点被妖怪夺去性命。一次偶然的机会，夏目巧遇猫神。猫神告诉他，夏目的外婆玲子有一本“友人帐”上面记录了所有被玲子打败的妖怪的名字，玲子死后，妖怪为夺回名字，才纠缠夏目。只有把妖怪的名字还给他们，夏目才能恢复宁静的生活。为了回到宁静的生活，夏目与猫神拿着“友人帐”开始了寻妖之旅，一段段关于妖怪的感人故事，就这样被引出。
圣杯是传说中可实现持有者一切愿望的宝物。而为了得到圣杯的仪式就被称为圣杯战争。
