世界受“魔甲虫”威胁，大地遭其占据，人类如今只能住在天空中的浮游都市里。人类当中诞生出以魔力对抗“魔甲虫”的魔法师——空战魔导士。就读空战魔导士培育机构——学园浮游都市“密斯特岗”的彼方·英司，是被冠上“黑之剑圣”称号的S128特务小队菁英王牌。然而，如今他却被视为“特务小队的叛徒”而受到众人轻蔑、厌恶……某天，彼方被任命为连战皆败的E601小队教官。这支小队收容了三名个性特异的少女——？由叛徒与问题学生少女们展开的雄豪进击，现在启动
由于时间公主时希的时间法术和御王黎灰的空间法术碰撞，带着叶罗丽仙境的仙子们一起进入了小朋友的内心世界。在这个充满童趣的玩具世界里，他们必须完成游戏和谜题，闯关成功才能回到原本的世界。另一边，每次整点报时，他们就可以从夹缝中回到现实世界，时希和黎灰通过四时钟看见了宇宙的奥秘，奇幻的星系、地球之外的天文世界瑰丽的展现
憧憬成为帅气的大魔法使的赛特，为了打倒来自天空的怪物涅墨西斯，每天都在努力的进行魔法特训，但赛特的训练一直不顺利，总是引起纠纷给村子里的人添麻烦。某一日，巨型涅墨西斯袭击了村子，为了拯救世界彻底消除涅墨西斯，赛特下定决心去寻找传说中涅墨西斯巢穴地，在旅途中赛特不断的遇到新的伙伴与新的强敌不断的成长。
恶女公主玛蒂娜因为自己抚养的帝国圣兽中毒身亡，被争夺皇位的哥哥流放落魄而死，她艰难寻找到重生的办法，决定重新养育圣兽，夺回皇位！重生后，她也知道了孵化和养育圣兽的真正方法，竟然是需要有才能之人的亲吻？！为了养育圣兽，玛蒂娜到处搜集有才能之人，但他们亲吻圣兽之后，却热情地问玛蒂娜：“亲爱的，我可以成为
今天开始我就是狙击手……!?日常被夺走，肢体上装备名为“LBX Unit”的战术兵器的5名少女——“装甲娘”。这些被选中成为转移者的少女们的使命，是对横跨多元世界不断侵蚀、增殖的金属生命体·米梅西斯进行扫荡及歼灭。跨越时空被强加的佣兵生活，那就是得以窥见世界「希望」与「绝望」、赌上性命的修学旅行！
