故事描述女主角小樱（木之本樱）与男朋友小狼（李小狼）和其他同学从小学毕业后升上初中的故事。在一次小樱做梦梦到53张樱之卡上面的图案都消失了，一名神秘人物出现之后库洛牌都碎掉了，小樱从这个梦醒来翻开封印之书发现库洛牌都变成透明的了!在与知世、小狼和艾力欧的讨论下，小樱重新踏上了收集透明牌的故事。
森林里的食物不再安全，一个神秘的小偷偷走了所有人的补给。长颈鹿戈迪失踪后，萨姆和基特开始着手调查。
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东方神娃化为光明之土和水飞向失去光明的太阳和月亮，天下重现光明。但黑暗势力经过漫长岁月的重生，培育出了黑暗斗士，侵袭人间，人类面临危机。为了平息浩劫，东方神娃经过太阳和月亮的再造又返回天下。可是黑暗斗士把天下猛兽变成了猛兽斗士，成为黑暗的杀手，人类与动物的战斗开始了。东方神娃经过自己的努力感化了猛兽斗士们，并与宇宙斗士们一起再次打败了黑暗之势，拯救了和平的地球。神娃到底依靠什么一次次化险为夷，并战胜了强大的黑暗斗士呢？迷底就要揭出……
聪明活泼的逗逗、迪迪希望能够成为帮助村民解决各种问题的酷比侦探。爷爷告诉他们：要成为真正的酷比侦探，必须通过重重考验，集齐100枚酷比徽章。他们接到村民们的求救：甜甜无故失踪、考拉的蛋糕被偷、阳光森林出现怪物。为了帮助村民，他们勇敢地开始了一系列充满冒险、趣味十足的“侦探之旅”。通过细心观察、层层推理，他们最终为村民们解决了一个又一个的难题，如愿获得酷比徽章。
