《康熙微服私访记2》沿袭该剧借古讽今、针贬时弊的新派古装轻喜剧作品风格，分为“馒头记”、“桂圆记”和“霞帔记”三个单元故事组成。“馒头记”里讲述康熙五十年，康熙（张国立饰）正值微服私访时居然被当地豪强骗进金矿做苦工；“桂圆记”发生在康熙五十一年，康熙抱病，宜妃（邓婕饰）让三德子（吴军饰）请太医为其诊治，病情反而加重。原来都是假药作祟，康熙愈后出宫，严惩不法之徒；“霞帔记”里讲述康熙五十二年，康熙大义灭亲，整治裙带关系。
大峳国由百里氏创建，与琅族隔山并存，征伐不断。峳皇和太子相继薨逝，峳皇的幼子百里昊和继位。时年昊和尚幼，遂由其母贺氏辅政。虽然已故太子之子百里鸿煊和百里鸿烁对幼帝忠心不二，且百里鸿煊还屡屡获得战功，保峳国百姓平安。但贺氏太后受佞臣挑拨，依然对百里氏两兄弟心存忌惮。幼帝虽然对两兄弟信任有加，有心扶助，但也是心有余而力不足。琅族的新首领明夜枫发现了平原王之女百里鸿熠的真实身份，鸿熠的身世之谜将百里氏推向深渊。此时神秘人发现峳国的皇城邺城出现了令人不安的迹象，遂暗中布局，希望能凝聚力量保天下百姓平安。
任慕妍（唐艺昕 饰）和张瀚宇（陈晓东 饰）彼此相恋，但这份真挚纯洁的感情却敌不过冰冷的现实和张瀚宇高高在上的董事长继承人的身份。最终，任慕妍被迫离开了张瀚宇，出国深造，实际上，慕妍的腹中已经怀上了张瀚宇的骨肉，离开了爱人，慕妍只能独自将孩子生下来，取名为豆豆（张籽沐 饰）。一晃眼多年过去，任慕妍学成归来回到了伤心地，但和离开时不同，此时的她已经变得自信而强大。再见到张瀚宇时，他已经成为了他的青梅竹马范昀（毛林林 饰）的丈夫，虽然心痛，但任慕妍还是选择放下爱恨情仇，将精力放在调查破坏集团经营的主谋身上。
东北地方军阀陆振华（寇振海 饰）因“九一八”事变而带着一家老小逃亡至上海，定居于法租界。生性温柔的八姨太文佩母女（徐幸 饰）被霸道专横的九姨太雪琴（王琳 饰）赶走，就连忠心耿耿的李副官（曹秋根 饰）一家也无法幸免。至此被赶走的两家人生活十分艰苦，文佩女儿依萍每次上门找父亲要生活费，都会被雪琴奚落一番，生性倔强的依萍与雪琴发生冲突，结果遭父亲鞭打，依萍自此对父亲家埋下怨恨。被赶后的李副官也只能拉黄包车过活，女儿可云（徐路 饰）又换上了精神病，李副官前来向文佩求救，但文佩一家也拮据得爱莫能助。这时，依萍为了生活，决定到歌舞厅当歌女。不久她认识了到歌厅采访的记者何书桓（古巨基 饰），当得知她是雪琴为女儿如萍（林心如 饰）介绍的男友时，顿生夺爱的念头。怎料在交往的过程中，依萍与书桓相爱了。但其实书桓的朋友杜飞（苏有朋 饰）悄悄爱上了如萍，正当如萍因失去了书桓，杜飞便采取了猛烈的追求，但如萍却只接受了他的友谊，杜飞却继续竭而不舍。当依萍的哥哥尔豪（高欣 饰）爱上了同是依萍好友的方瑜（李欣 饰）相爱后，才知道原来可云的病，是因为当年可云怀上了尔豪的孩子，孩子因病死后，可云就变得疯疯癫癫的。众人决定为可云找回原来的记忆，恢复原来的样子。一段断儿女情长，姐妹恩怨，又能否在一起经历的事情中得到化解呢？
朱秀容（关咏荷 饰）经营着一间烧饼铺，生意极好，誉满京城。尽管朱秀容容貌端庄秀丽个性又热情开朗，但家中有一十分难缠的瞎母（吴云芳 饰），因此屡屡吓跑想要山门提亲之人，于是，年近三十的朱秀容至今依旧孤身一人，待嫁闺中。
解放战争时期，国民党政府为了挽救大溃败的趋势，进行了所谓反走私反腐败的“犁庭扫穴”行动。参与行动的缉私总署侦缉队队长唐景云深入敌后，意外发现走私组织的核心成员竟然是自己的妻子袁淑英。在深入调查的过程中，唐景云被人陷害，成了走私组织和腐败官员的替罪羊。为了洗清妻子的身份污点，为了证明自己的清白，揪出真正的幕后黑手，唐景云打入走私组织内部寻找真相。他以不同的身份周旋于国民党腐败官员、缉私总署与走私组织之间，与妻子袁淑英一起面对各种困难险阻，携手抗敌，历经生死磨难。在困难重重的敌我斗争中，夫妻二人得到了地下党的帮助和支持，逐渐认识到共产党和国民党的区别，最终加入革命队伍，为解放事业贡献了自己的力量。
爱好写作的少女南星（沈月 饰）在许愿时意外召唤出了自己书中的反派角色萧无敌（陈哲远 饰），聪明狡诈的萧无敌刚来到这个世界，就对南星连威胁带勒索地住到了南星家隔壁，两人开始了鸡飞狗跳、打闹不断的邻里生活。
