《康熙微服私访记2》沿袭该剧借古讽今、针贬时弊的新派古装轻喜剧作品风格，分为“馒头记”、“桂圆记”和“霞帔记”三个单元故事组成。“馒头记”里讲述康熙五十年，康熙（张国立饰）正值微服私访时居然被当地豪强骗进金矿做苦工；“桂圆记”发生在康熙五十一年，康熙抱病，宜妃（邓婕饰）让三德子（吴军饰）请太医为其诊治，病情反而加重。原来都是假药作祟，康熙愈后出宫，严惩不法之徒；“霞帔记”里讲述康熙五十二年，康熙大义灭亲，整治裙带关系。
中秋灭门夜，秦家遗孤秦时月（李百惠 饰）被督军戴世尧（何昶希 饰）收留。为查清父亲冤案，她周旋于兄弟间——阿笙（陈建宇 饰）从掠夺到深爱，戴世尧从怀疑到动情。当战火重燃，三人冲破宿命：阿笙为爱弃刃，戴世尧为城舍爱，秦时月终在血色中寻得真相与新生。
现代入殓师张楚溪阴差阳错的穿越到岚国王朝唯一的“女王爷”身上，且刚一醒来时就惨遭太子派来的刺客苏宁泽的刺杀。一心想要拥有一段完整恋爱的张楚溪，在扑朔迷离的皇族权谋中拨开迷雾、险象求生，也在接二连三的事件中与苏宁泽坠入爱河。然而就在二人终于敞开心扉决定走到一起的时候，张楚溪穿越的本体逐渐苏醒，开始剥夺张楚溪的意识。邪恶的王爷即将回归，她究竟为何女扮男装？刺杀者与张楚溪有怎样的牵扯，张楚溪与苏宁泽又有怎样命中注定的宿命姻缘？
讲述了因"无根本"单科大学合并，计算机工学系和模特专业成为同一专业之后展开的大胆的青春罗曼史。
香港SARS疫潮过后，人们终于从阴霾中走出来。脑外科医生程至美突然得知前女友的死讯，情绪崩溃，极度自责抑郁。法医岑雅晴伴其左右，鼓励他重新建立信心。急症室医生黎国柱结束了与女友的恋情，却卷入与骨科医生叶淘及见习医生曾淑淇的三角恋中。不幸感染SARS的心脏科医生林敏智留下后遗症，为保全名声而隐瞒病情，却令病情日益恶化。妇产科医生万安生与急症科医生向众仁正计划共同生活，然而却因护士戴玉莹的介入而面临一场情感考验。
