《康熙微服私访记2》沿袭该剧借古讽今、针贬时弊的新派古装轻喜剧作品风格，分为“馒头记”、“桂圆记”和“霞帔记”三个单元故事组成。“馒头记”里讲述康熙五十年，康熙（张国立饰）正值微服私访时居然被当地豪强骗进金矿做苦工；“桂圆记”发生在康熙五十一年，康熙抱病，宜妃（邓婕饰）让三德子（吴军饰）请太医为其诊治，病情反而加重。原来都是假药作祟，康熙愈后出宫，严惩不法之徒；“霞帔记”里讲述康熙五十二年，康熙大义灭亲，整治裙带关系。
1941年秋，大批日战机猛烈轰炸成都。百年老字号锦江春的少掌柜杨少诚亲眼目睹驻防司令叶怀忠的吉普车发生大爆炸。叶司令当场炸死，副官凌辉浑身是血受了重伤。少诚送他去了医院。军统站副站长陈剑锋赶到未来岳父叶司令的被炸现场，吃惊的发现吉普车底下隐藏了一枚德国产的定时炸弹残骸，他立刻意识到，这是一起谋杀。医院里凌副官看到行动队长许尔根带人闯了进来，偷偷将一个美式烟盒放到了少诚的口袋里。许尔根将少诚和凌辉带回军统站审讯。叶司令的女儿叶眉在军统站做机要员，她得知少诚救了共党潜伏在司令部的特工凌辉，持枪闯进审讯室，要枪毙少诚，被陈剑锋劝住。
1949年，中国以及这片土地上的人民迎来了最为关键的一年。共产党势如破竹，在三大战役上接连取得胜利，国民党方面则溃不成军，抓紧一切时间抢夺物资，撤离大陆。作为全国金融中心的上海，更成为各方势力争夺、搜刮的重点。时任国民政府中央银行秘书处处长的黄铭受命运送巨额黄金前往台湾，起身为地下党的儿子黄以轩（郭晓冬 饰）则试图策反父亲前往解放区，而以轩的姐夫孙世安（姜武 饰）——国民党上海情报站副站长在得知消息后百般阻拦，与黄氏父子展开连番明争暗斗。
女演员田净植因为一场车祸，阴差阳错的苏醒了基因突变人薛灵乔，二人经历磨难，消除彼此的误解，陷入爱情。为了让田净植过上平凡的生活，薛灵乔选择离开。不久后，田净植怀孕，薛灵乔担心田净植母子的安危，秘密住在田净植家隔壁。田净植偶遇云臻，二人志趣相投。云臻向“准妈妈”田净植展开了强烈的追求攻势。以秋月白为首的“S组织”得知田净植怀了薛灵乔的孩子，以小舅的身份留在田净植身边，实则利用田净植母子为组织谋利。与此同时，田净植身体出现排异反应，而城中的女性失踪案屡次发生。为了保护心爱的人，更加为了避免殃及无辜，薛灵乔再次卷入这场基因突变人引起的风波中，设法解除危机。事件解决之后，田净植肚中的宝宝顺利出生，一家三口幸福的生活在一起。
该剧讲述一对双胞胎姐妹刚出生便被迫分离，不同的成长环境造就了两人迥异的性格，巧合的是，长大后两人却爱上了同一个人，上演了一出纠结的三角恋情。
大神总裁叶天被困盘古系统生命遭遇危机，虚拟格斗一姐白薇展开营救的奇幻甜爱故事。
抗日战争时期，杨晓冬被派到古城领导地下工作，他亲自散发抗日传单，面斗伪省长吴赞东；智斗蓝毛护送首长过封锁线；反抢粮夜闯伪商会；入虎穴只身说服 伪团长关敬陶起义。在他的领导下，与韩燕来、小燕、周伯伯、武工队的梁队长、膘子等古城地下工作的战员，组成了抗日的坚强堡垒。
该剧共由36个独立的小故事构成，囊括异地恋、初恋、姐弟恋、劈腿等多种感情现象，立足当代情侣关系，刻画当代年轻人对情感的探索与成长。每个故事既有个性、也有共性，聚焦当下年轻人普遍面临的36个情感问题，向观众全方位展示何谓爱情。
