五超人在执行任务中，意外发现体内暗藏了能控制他们的程序代码，在调查过程中，超人们发现所有的线索都指向了宇宙开发集团五金公司。超人们为了解开谜题，踏上了寻找真相之路，五金公司的阴谋也逐渐浮出水面。原来，五金公司曾经拥有过诞生超人们的超能机械石，并试图将超人改造成为自己的武器，从而称霸宇宙。超人们得知真相后，合力摧毁了五金公司，解决了宇宙的危机。
新干线超进化研究所为了从诞生于“漆黑新干线”的巨大怪物体手中守护日本的未来，人们开发了“新干线变形机器人SHINKALION”。具备与SHINKALION较高适合率的孩子们成为驾驶员，与研究所员齐心协力，面对强大的敌人！究竟“漆黑新干线”的目的是……。孩子们能否守护日本的未来……。变身！SHINKALION！
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有一颗叫D60的行星，这颗星球是巨人幻兽战士们用来修炼的地方。失去记忆的雷古洛思奥特曼为了掌握“宇宙幻兽拳”，与好友迪亚斯一起在这颗星球修行。 雷古洛思以前在交流拳法的时候认识了雷欧奥特曼。结果某天修炼的时候，雷古洛思听说了一件令人震惊的消息，雷欧的故乡L77星被马格玛星人毁灭了。在那之后没多久，马格玛星人的魔爪也伸向了行星D60。雷古洛思与修行宇宙幻兽拳的战士们并肩作战，最终驱逐了马格玛提督沃鲁冈所率领的侵略军团。虽然雷古洛思等人取得了胜利，但也付出了沉痛的代价。 雷古洛思深刻意识到自己的实力还很弱小。他为了增强自己的实力，每天除了道场的修行，还开始了秘密训练……
在某个时间点的日本，突然出现了文学书全部被染黑的怪异现象。 这是由书中带着负面情绪诞生的“侵蚀者”所导致的灾难。 被侵蚀的文学书，会逐渐地从人们记忆中消失，最后变得像是从一开始便不曾存在过一样。 于是，有特殊能力的“炼金术师”作为特务司书被派遣至图书馆， 为了对抗破坏书 中世界的“侵蚀者”、为了守护文学，与转世的文豪们一起战斗。
