故事叙述阿空、阿静、阿能、阿震、阿风和杨一击等六位个性迥异的年青人，在曾受过军事训练的唐少校、柯娜和福伯带领和帮助下，互相融合、互相接纳、彼此学习，逐渐成长为拥有强大的爱心、超凡的意志及守护正义的能力的有为青年，组成了团结勇敢、战无不胜的“巨神战击队”。 六个年青人运用各种高科技神奇力量去对抗想要破坏并占领地球的邪恶势力，他们不断地迎接一次又一次挑战，不断地在战斗中学习成长，在历经无数次艰难险阻之后，最终在大家团结齐心的不懈努力之下，战胜了邪恶力量，保护了地球的和平。
蓝星大陆遭受磁场风暴，导致环境剧变，灵气复苏。在天地灵气的滋养下，人类和动物的各项身体机能被无限激发，历经漫长的岁月洗礼，形成了灵兽和人类常年对峙，争夺生存空间的紧张局面。
曾经，这是一个人类和魔法共存的世界，但一场意外的发生令魔法就此消身匿迹，一晃眼就是1000年过去，人类甚至连他们曾经拥有魔法这件事情都给忘记了。小日向满月（岛袋美由利 配音）是一名个性活泼开朗的女子高中生，不擅长拒绝的她无论别人拜托什么事情都会满口答应下来，因此在当地人缘非常的好。一天，小日向满月邂逅了一位名叫新月艾尔涅丝塔深海（种崎敦美 配音）的神秘少女，看上去冷漠孤傲拒人于千里之外的少女，也被小日向满月的热情给融化了。在新月艾尔涅丝塔深海的带领之下，小日向满月第一次知道这个世界上存在着人偶阿尔玛诺克斯，同时亦得知了魔法并没有完全绝迹的真相。
成功营救药老后，重伤的萧炎被带回星辰塔闭关。得益于三千焱炎火和星辰之力的修复，沉睡了一年的萧炎终于苏醒，并晋升为斗尊。为了修复药老的本源魂气，萧炎决定前往远古时期斗圣留下的遗迹。然而，无数势力都觊觎此地的天阶斗技和斗圣骸骨，在遗迹未开启之前，已经有多方势力汇聚于此，所有人都想分一杯羹。与此同时，魂殿的威胁也迫在眉睫，萧炎唯有火中取栗，方可博得一线生机。
以水乡绍兴为背景，主人公机智可爱，剧情精彩纷呈，动画制作精良，歌曲清新婉丽，似缓缓展开的一轴绍兴特色江南画卷，吞吐千年文化之神韵。
【合集篇为正片剧情剪辑合并，与正片相比无新内容】【合集篇内容于3月9日转成会员可观看】六千年前，魔神皇枫秀与七十二根魔神柱从天而降，所有生物沾染魔神柱散发的气息，立刻会变异成魔族生物，人类随之进入黑暗年代。随后，人类强者自行组织六大圣殿，阻挡魔族前进的脚步，逐渐形成人魔共存的局面。 主角龙皓晨，为救母加入六大圣殿之一的骑士圣殿成为一名骑士，在一步步成长冒险中，奇遇，诡计，命运般的爱情与友情不断在他身上上演。龙皓晨坚守骑士精神，通过自己的人格与努力，赢得他人认可。他先是与六大圣殿其他天才少年组成“1号猎魔团”对抗魔族，为人类的生存与尊严奋战。同时不惜献出生命，守护自己的伙伴与最珍贵的爱人。而世界的局势变化难测，更多的阴谋在酝酿，更深的秘密也等着他去揭开。 而最终龙皓晨是否能赢得神印王座的认可，登上骑士圣殿的最高荣耀，同时他又是否能面对所有真相揭开的那一刻，化解整个世界最大的危机，一切都有待揭晓。
牙狼动画版第二季改编自日本系列深夜特摄剧《牙狼》。动画版第二季将设定在日本平安时代，以女性版安倍睛明为主角，讲述她降妖伏魔的传奇故事……
