随着和平的到来而走向近代化的木叶忍者村。高楼林立，巨大显示屏中播放出影像，连结各区域的电车在村里奔驰。虽说是忍者村，但一般民众也增多，忍者的生存方式也在逐渐改变的这个时代—— 村子的领袖，第七代火影·漩涡鸣人的儿子慕留人，进入了培育忍者的学校“忍者学校”。周围的学生们带着“火影的儿子”这样偏见的目光看待慕留人，但慕留人凭借天生的破天荒性格将这种小事轻松越过！ 慕留人与新的伙伴相遇，他将如何挑战突然发生的神秘事件？ 在众人心中如疾风般狂奔的“漩涡慕留人”的物语，现在开始！！
本是小镇一介普通少年郎的独孤败天，一心寻求武学真谛，却为人算计遭受情劫，被迫卷入武林纷争，因魔的身份为世人所误解，为了生存苦苦挣扎，逐渐觉醒前世记忆，走向一条抗天之路，并在此过程中收获最真诚的友情和最可贵的爱情。即使历经千劫万险，纵使魂飞魄散，依旧保持初心，为自己、为命运、为正义而战，无论对手如何强大，他也从未退缩。
道宗一脉相承，分为四派即青龙、白虎、玄武、朱雀。四派相约共守天下。不料玄武欲霸武林，用美人计挑唆四派互相攻伐。青龙告急，却引出一个惊天大阴谋！执明国国王正因为玄武国的召集令的人选而困扰，女主作为本国公主主动为父分担，在挑选人选的途中遇到了躺睡街头的男主......
在太一一行人告别数码世界后，数码世界并没有就此关闭朝向人类的大门，而数码世界的内部却没有太平多少时日，就又开始了纷争。数码世界急需一批被选中的孩子来维护数码世界和人类世界的和平。太一、阿和、素娜等人都已先后成为了初中生，没有太多精力和时间能够和数码宝贝们一起并肩作战，只有阿武和小光成为了新一代的领头人。被选中的孩子有本宫大辅（木内玲子 配音）、井之上京（夏树莉绪 配音）、火田伊织（夏树惠 配音）等人，和他们一同战斗的除了亚古兽、加布兽等，还有新的数码宝贝参与。于是，在第一代数码人的带领下，新的数码宝贝和守护者们开始了同邪恶势力的作战……
