动画电影《银河宝贝》讲述的是一个在外太空的故事，在银河系中有一颗机器人的行星，叫哈帝星，由于哈帝星科技的高速发展，机器人这种消耗能源的群体将面临巨大危机，但是犀牛博士研究出了一种叫做“蒙多拉晶石”的宇宙物质能给哈帝星。
为了找到亚特兰蒂斯的三叉戟并统治整个海洋，塞壬偷走了传奇之书。神奇女侠、女超人等再次齐聚，粉碎塞壬的计划。
狡猾的坏蛋联盟团伙实施一次险象环生的万圣节盗窃行动，目标是恐怖豪宅中一件价值连城的护身符。会出什么乱子呢？
堂本一辉是著名的钢琴演奏家，两年前突然宣布不再演奏钢琴转而攻向管风琴，更斥资建造了堂本音乐厅，准备在落成之日举行演奏会。然而在演奏会之前，堂本音乐学院的学生相继死去，先是爆炸案，后是单个被杀。园子带着柯南一行人来听排练，认识了女高音歌唱家秋庭怜子，拥有绝对音感的秋庭也开始遭遇到危险：润生茶被下药、作森林浴时遭遇空气枪袭击、试演会当天更遭击晕。然而就是从这些事件中，柯南找到了推理的逻辑：凶手试图把秋庭排除在凶杀外。这边已经正式开演的演奏会浑然不知音乐大厅外已是爆炸连天，小兰、灰原哀以及演奏厅内的一千多人顿时危在旦夕，绝对音感成为了唯一的救命线索。柯南找到了爆炸的逻辑，要在罪犯引爆最后一个炸弹前，把他找出来。
兔二、玄影等功夫学校的小伙伴们每天在学校里开心的练武，快乐的生活。突然有一天，功夫学校对面一夜之间冒出一家充满科技感的“神府学校”，吸引了大批小朋友去报名。于是，两家学校就开始了一场“传统”与“科技”的较量……。功夫学校的老师接连失踪，同学一个个离去，兔二、玄影两个性格迥异的孩子默默的守护着自己深爱的学校。这时，一些奇奇怪怪的机器人出现在他们的面前…… 咔嚓、咔嚓、 呲………
动画最后六集重新剪辑的特别电影版本
蜜蜂哈奇继续他的旅程，与失去的母亲团聚。然而，在穿越森林的过程中，他误入了人类居住的小镇乌贼镇。在那里，哈奇遇到了艾米，一个能与昆虫交谈的神秘女孩……
风和日丽的一天，阳光温暖地洒在木地板上。一个红色的锡铁小兵来到了这个新家，他好奇地注视着周遭的一切，却不知道危险将至。不久，憨头憨脑的婴儿从隔壁爬了进来，他粗暴地对待身边的玩具，这令锡铁小兵新生恐慌。小兵想偷偷逃跑，但是他随身带的小鼓却叮当作响，这响动自然而然引起了婴儿的注意，一场体型悬殊的追逐战就此展开。
