改编自中国知名作家郑渊洁原著《舒克和贝塔历险记》，故事衔接上一季，再续经典。讲述舒克贝塔在皮皮鲁的帮助下建立机场，成立航空公司，维护着森林里小动物们的出行安全，也让更多老鼠通过劳动换取了食物，改变着老鼠的坏名声。然而这一切被海盗鼠们盯上，他们设计圈套，抢占机场......几经周旋、奋战，舒克贝塔和机场员工齐心协力战胜了海盗。
为了对抗突然出现的人类之敌「涅洛伊」，世界各国组成了联合军。
泰羽为了修理雷霆战爪，来到神匠的工作室，大彭无意间找到了人造精灵明灵的设计图纸，在设计出两只明灵后，竟机缘巧合地救出了困在棱镜中的神匠。
大战过后，森林一派祥和，舒克贝塔航空公司又恢复了正常运转。谁也没想到平静的生活会被一桩不起眼的盗窃案打破-舒克贝塔从一伙蒙面鼠窃贼手中截获了半张神秘的藏宝图，而图中的坐标指向当年舒克流放海盗的小岛。
