传说中每当天道沦丧，轮回走到尽头时，无尽界域中就会诞生十头“太古混沌兽”，他们所到之处天崩地裂，时空颠倒，恒心衰亡，众生罹难。炎黄学子李天命，虽然因奸人陷害辍学，却不气馁，坚毅的精神打动了传说中的“太古混沌兽”，李天命于神兽一起重回炎黄学院，并铲除奸佞，拯救病危的母亲。
神秘的外太空，出现了全新外星大反派！智羊羊与丽羊羊再次出现，喜羊羊妹妹首度亮相？全新的角色、发明、剧情，羊羊们这次该如何化解危机？
为了从迷之巨大怪物手上守护日本的和平，新干线超进化研究所开发了「新干线变形机器人 辛卡利欧」。 为了防备新的敌人袭来，研究所还秘密开发新型机器人「辛卡利欧Z」。 与「辛卡利欧Z」适合率高的孩子们被选作...
时为公元2202年。自从宇宙战舰大和号从那场单程长达16万8000光年、通往伊斯坎达尔的壮大航海中回归以来，已经过了3年——。在“宇宙恢复系统”之下取回先前蓝色样貌的地球，与卡米拉斯帝国缔结了和平条约。在复兴的同时，为了防卫而进行的包含最新锐战舰安德洛墨达在内的新锐舰队的整备工作也在推进中。伊斯坎达尔的丝塔夏的愿望也化为乌有，地球开始迈向扩军之道。这真的是在无可替代的多数牺牲之后，大和所达成的真正的和平吗？期盼宇宙平稳的女神特蕾莎的祈愿，将大和邀往新的航海。如今，席卷宇宙的加特兰蒂斯的威胁，正在逼近地球——。
动画第4期的分割播放，副标题为“走光篇”（ポロリ篇），内容为原作漫画尚未动画化的日常内容。
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