浑沌支配了大陆──人民畏惧著各种灾害。君王们手持著平息浑沌的〈圣印〉守护百姓。然而随著岁月流逝，君王们逐渐忘却了“守护苍生”的理念，为了争夺彼此的圣印和领地，掀起了一波又一波的战争……魔法师希露卡唾弃毫无风骨的各地君王，而浪迹天涯的骑士提欧则是为了解放受苛政所苦的家乡修练武艺。
《命运石之门第二季》主人公冈部伦太郎经历无数的苦难，跨越了尽头悲哀的放弃了挽救“她”的世界线的故事。 失意至底的冈部伦太郎。 被“封印”的“凤凰院凶真”。 担心他的伙伴们。 新登场的角色们。 未被拯救的“她”到底怎么了？ 《STEINS；GATE》中没有登场的新的角色迎来被描绘的“0”的故事。 是的，那里的“她”现在也在——
沈安落魄之时收到了一条来自未来自己的短信，让他趁着灵气复苏之前准备好去千灵山，吸收灵气为即将到来的全民修仙时代做准备。在未来自己三番两次的成功预言后，沈安终于相信开始准备前往千灵山吸收灵气，期间偶遇了特殊部门的美女白微微。白微微一行也在寻找灵气出现的地方，奈何比沈安晚了一步，所有灵气被沈安全部吸收。白微微察觉到沈安不是普通人一直派人跟踪监视，沈安身上的秘密也逐渐浮出水面，在未来自己的指引下，沈安找到了当初陷害自己的人并且成功报了仇，又帮助特殊部门重建了地球，保护了全民修仙时代的修士。
