灵感少女夜宵因交通事故失去了双亲，母亲的灵魂还在事故时被恶灵夺走，为了找回夜宵母亲的灵魂，拥有通灵体质的萤多朗和夜宵一起前往恶灵弥漫的灵异地点。
基因石能量渐渐恢复成基因石，且显露出更强大的力量、更多不为人知的秘密。反派势必不会轻易罢休，将以更强大的姿态卷土重来。但在艰难的挑战中，普力士等人仍看到了希望：宇宙中，分散著为数不明的「变形联盟战士」，这群代表正义的首领勇士若聚集起来，将会成为一股巨流，一起勇敢地为守护地球而战！
贫民窟里盛开的白百合——温泉小镇巴斯发生涂鸦事件后，威廉心中浮现出的思绪……
继萌宝战警第二季之后，宇宙邪恶势力世星大帝以及余党铁算盘、塔库玛司令之类再次受到挫败，萌宝战警拯救了地球上的恐龙等古生物，这些活化石见证了整个地球的繁衍盛衰，同时也回归到了适合的生存环境，它们将于人类和谐共处。
