公历2061年，日本被4个世界主要经济圈分割统治、支配，日本人作为从属国的人民，每日过着悲惨的生活。也因各经济圈投放的人型特殊机动兵器AMAIM，使日本成为世界的最前线。喜欢机械的少年椎叶アモウ，某日与自律思考型AI「ガイ」相遇。以此为契机，アモウ坐上自己组装的AMAIM「ケンブ」，投身于夺回日本的战斗之中。
普通的女子高中生·枫在一条陌生的巷子里醒来。那里是一个有兽人、精灵和龙的不寻常的异世界。枫注意到她持有的背包里有一本陌生的书。那是一本只要念出‘生成’就能变出药水的神奇书籍！对于被扔到异世界的枫来说，生成的药水成为了生活的支柱。虽然渴望有一天能回到日本，但枫作为女子高中生在异世界的奋斗仍在继续……
故事讲述自东京大地震的十年后，人们逐渐淡忘这场大灾难所带来的恐怖回忆，而当时亲身经历了这场灾难的五十岚丸太，却因为当时的意外而失去了记忆。现在的丸太与其他同学一样过着普通而又平凡无奇的每一天，但这一切后来都被打破了。有一天，一名“红色男子”突然现身学校，并将在场所有丸太的同班同学杀害了，虽然只有丸太得以幸存，但这也彻底改变了他的命运。本应被拯救了的丸太，却被冠上莫须有的罪名并处以“死刑”，被强制送进了完全民营化的监狱“DEADMAN WONDERLAND（亡灵幻境）”。亡灵幻境是以东京复兴为目的，在日本建立了唯一的完全民营化刑务所，表面上是为了囚犯而建立，并让人观光的乐园，但其实是所利用死囚互相厮杀，藉此吸引大量金钱投资，并把拥有特殊能力的死囚来做实验的不人道之地。在这充满绝望的“乐园”里，丸太和神秘少女・白再次相遇……
千百年来，女娲与原始天魔分别代表着正义与邪恶，自女娲创造出人类那天起，正与邪的较量就从未停止过。为统治人类，天魔派出天地盟主将神兽魔化，攻下了玉龙国。南宫城主南宫逸差遣儿子南宫问天和女儿南宫问雅代表自己到民间帮助受难的众生。兄妹二人各有绝活，他们和玉灵龙一起与天地盟主展开了殊死搏斗。杀至你死我活之机，神兵兽兽破壳而出，演化为神兵天晶，他与问天兄妹、玉灵龙一起，决意打败天地盟主，救出身处险境的父亲。于是，他们一路收集神兵神兽，历经千难万险，向邪恶势力发起了进攻......本片取材于香港漫画大师黄玉郎的《神兵玄奇》。
