恐怖组织“瓦干布”渗透香港，在香港掀起一场化武争夺战，飞虎队总指挥范少锋（陈豪 饰）临危受命，率飞虎队与恐怖分子斗智斗勇。飞虎队身陷瓦干布的无情杀局，特勤队警司展博文（马德钟 饰）召集警界精英张伟桦（张兆辉 饰）、张嘉轩（黄宗泽 饰）和高子乐（吴卓羲 饰）成立秘密反恐小组S Team。面对重重危机，在国际刑警许俊飞（苗侨伟 饰）的协助下，中青两代最终放下恩怨情仇，联手阻止化武病毒在香港蔓延。
清末民初，富商林家被一夜灭门，后林家独女林梦辰辗转被卖到不义富商黄家，给家中过世的儿子冥婚，梦辰即将被活埋之际，杀手组织血祭堂的头号杀手晓生，正好接到任务灭杀黄家，阴差阳错间救下梦辰。梦辰目睹了晓生杀人的整个过程，不仅没有害怕，还将执行任务的晓生视作恩人，叶晓生决定将林梦辰带在身边，从此兄妹相称此生护她周全。转眼十年过去，晓生为了让“妹妹”有个良好的成长环境，一直活在双重身份中，他在家中、在梦辰面前是商人叶掌柜，做些洋行的买卖营生。在梦辰看不见的暗处，仍是血祭堂的头号杀手。但晓生不知道的是，自己呵护十年，单纯天真的妹妹梦辰，竟然摸清了自己的底细，还暗中加入血祭堂，成为了自己的女徒弟——新人杀手谷雨。
上世纪30年代的东北，在一家名为“和平饭店”的奢华酒店中，一群神秘的客人被封锁其中，在一个闭合的空间内合纵连横，展开了长达十天240小时的生死博弈，更是牵动了当时的世界格局。东北敖东城黑瞎子岭土匪二当家王大顶，在追查一批即将流入民间的鸦片膏时意外进入到和平饭店内，并遇见了南铁情报部门机构特聘的行为痕迹分析专家陈佳影。此刻，警长窦仕骁为了追查携带重要证据胶卷而潜入和平饭店的文编辑，下命令封锁整个和平饭店。陈佳影作为潜伏的共产党，为了能将藏有日本在东北试验细菌武器证据的胶卷送出和平饭店，并突破日本宪兵队的包围，只好和萍水相逢的王大顶假扮夫妻，躲避日伪敌人的调查。与此同时，作为世界政治格局的缩影，和平饭店入住的每个客人都不简单，日本、德国、美国、法国、苏联、中统、军统等各方代表都将在和平饭店内展开合作和斗争。
该剧以三大战役为背景，塑造了以柴福东为首的共军特工队和以马伯驹为首的国民党军统之间的殊死较量。《冷枪手》集谍战、枪战、夺宝等精彩元素于一体，突出表现了特工队的成员们的才智，众心如城为完成民族大义。
通过爱情与科幻等元素，展现了陆森（梁靖康饰）与杨善善（孙千饰）的爱情之路。
