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——虽然很突然，但世界已经灭亡了。1000年前一度毁灭的地球，由名为“Y”的传说中的时钟技师以时钟装置再构筑而成的世界。吊车尾高中生·见浦直人，与“Y”所留下的自动人偶琉珠，以及天才时钟技师少女·玛丽相遇了。当他们的能力相互咬合时，命运的齿轮开始转动。不断重复破裂与延命，将即将崩坏的地球（“时钟机关之星”）修复的时钟朋克·幻想剧！
在一片未知大陆上，有一座名为9号卫星城的城市，城中螺丝厂的螺丝扶正工芮梨在日复一日的枯燥工作中，逐步察觉到了这座城市的不真实。在神秘角色“Anull”的帮助下，芮梨获得了“换装”的超能力，并化身怪盗“天狼星”，为逃离这里秘密行动着。当世界的真相终于展现在自己眼前时，芮梨才发现，她真正的战斗才刚刚开始……
新的恶势力登场，她就是卡奥斯的女儿“卡拉”，卡拉想要利用派尔来复活自己的父亲与之抗衡的现役英雄们和光环学院的学生们! 都在努力学习新技术。这时又一个新登场的胶冻族的成员“派尔”！失忆的派尔开始寻找自己的搭档。慢慢恢复的记忆还有他奇怪的行为，派尔到底是谁呢？光环学院的学生们是否能够成功阻止卡拉复活卡奥斯呢？
西历5012年。突然入侵地球的＜外星人＞与其制造的＜机械生物＞导致人类面临灭亡危机。
