《晶码战士》是一部大型科幻动画片连续剧，以“环保”为主题，围绕“历险”、“励志”展开，讲述了四位主人公与他们的晶码兽为了保护地球，与外星球邪恶集团作斗争的故事。
友一班上的校外教学旅行的钱被偷了，而偷钱的那个人就是自己好朋友5人组的其中一人。那个人因为欠下2千万的债务，而偷走旅行的钱当做报名朋友游戏的报名费，想要好朋友一起帮忙还清负债。5人虽然不清楚是谁做的，可是基於友情，众人决定一起承担，参加游戏。可是事情却没有想像中的简单，因为他们里头有背叛朋友的人。
在历史悠久，文化底蕴深厚的故宫之中，住着很多可爱的猫猫，在人类看来，它们过着令人艳羡的悠闲生活。其中有六只御猫与众不同，它们肩负着保护文物记忆——“物华”的重任。它们进入物华的世界，一次次战胜破坏者黑枭，让物华世界重新回归到正确的轨道上，从而守护文物。这六只御猫分别是文班的鲁班、么么，和武班的霜眉、鳌拜、平安、小仔，它们智勇双全、默契无间，组成了守护国宝物华世界的——紫禁御喵房。
天才少女小珍和她的冒险家爷爷发现了“恐龙小岛”，岛上种类丰富的恐龙和睦相处，拥有智慧，能与人类对话。小珍和爷爷建造了最尖端的城市“恐龙小镇”，组建了恐龙救助队“龙宝小英雄”。可是，在恐龙小镇上还有一个坏蛋科学家阿麦，总是给他们惹出了各种事端……
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