神秘生物的出现，宣告着地球将成为名叫渊种怪物的游乐场。只有击败所有的渊种，才能取得胜利。一旦失败，地球将沦为神秘生物的食物，作为肥料的人类却有了一批生猛的力量。
静电超强力？午饭变酸了！没想到这个世界除了有烦恼星人，还有麻烦分子！麻烦分子比烦恼星人还小，小到肉眼看不见，超迷你战士必须把自己缩小到千分之一，才能进入纳米世界打击新形态的敌人；麻烦分子看起来天真无辜，却能对人类世界造成极大的麻烦，到底它们从何而来，又有什么目的呢？快呼叫超迷你战士，打败你的麻烦！
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屹立于瑞拉王国中央的魔法学院，是所有孩子们的梦想之地，故事便发生在这所神奇的学院中。森川大法师的女儿美星进入魔法学院学习后，结识了小樱、美烁、明杰、郝男等，大家成为了好朋友一起学习生活。突然有一天，学院里的心石和美星父亲森川大法师一起消失了，为了寻回心石，还父亲清白，美星与伙伴们踏上了寻找之路。
故事发生在静冈县沼津市海边的小镇、位於内浦的私立浦之星女子学院。在这间骏河湾一隅的小小高中里面，以2年级的高海千歌为中心的9名少女，怀抱著远大的梦想挺身而出。那就是，要成为闪闪发光的“学园偶像”！只要努力不懈梦想一定会实现──。现在只需要朝著那闪耀的目标，奋不顾身地勇往 直前就行了！ 从此，少女们“ 大家一起实现的故事”（学园偶像计划）就此展开！
