宇宙世纪0153年，这个时候地球联邦已经名存实亡，统治衰颓腐朽，宇宙殖民地纷纷脱离控制，地球圈成为诸多军阀逐鹿的场所；建立于Side 2的新兴国家赞斯卡尔帝国开始对地球的侵略，联邦军根本无法阻挡，只有民间军事组织“神圣军事同盟”还在坚持抵抗。出于一个完全偶然的机会，少年胡索·艾文成为神圣军事同盟的驾驶员，被赋予了最新锐的机体，V高达……
在永夜国度亚巴顿，7岁的艾茜被黑暗领主墨菲斯特从战场捡回王城。为阻止漫画中的灭世结局，她努力化解两国仇恨，却意外引发领主与圣骑士长的宠女内卷。当战争阴影再度降临，唯有跨越时空的拯救才能解开死局——而这一切，都始于两个爸爸的育儿经对决。详细
乔纳森·乔斯达与DIO决战后的一百年，DIO复活了。同时，乔瑟夫的孙子，空条承太郎发现自己有幽波纹（替身）能力，DIO的复活影响了没有替身抵抗能力的母亲，陷入病危情况；为了拯救命在旦夕的母亲，承太郎与乔瑟夫出发前往DIO的所在地——埃及。
大好真人（石谷春贵 配音）是一位非常平凡的男子高中生，和大部分的同龄男生一样，真人对游戏和那些勇者斗恶龙的古老传说有着很大的兴趣。唯一令真人感到困扰的是，他拥有一位对他过度保护和过度关心的母亲真真子（茅野爱衣 配音），虽然明白母亲是因为非常的爱自己才会如此表现，但母亲的爱常常令真人感到喘不过气来。
热爱科学的小男孩尼克，在3D打印机上创造了拥有智慧的机器人，并成为了他的小伙伴。机器人小伙伴们个性迥异，都有特别的“功能”，和尼克有着深厚友情。他们会为谁是尼克最好的朋友而争吵，他们经常试图帮助尼克，但常常帮倒忙而让事情更糟糕，但只要他们团结在一起，发挥各自长处，往往就能实现了不起的成就。
