本剧改编自手冢治虫的同名漫画，讲述了由于幼年时期与母亲发生的心理创伤，变得讨厌爱的近石昭吾（佐藤胜利 饰），住在不爱的女性家里，拿钱维持生活。昭吾只对与青梅竹马的渡弘美（髙石明里 饰）的关系感到特别，但某天，昭吾得知弘美对自己抱有好感，因为恨爱而犯了决定性的错误，害死了弘美。昭吾在自己所到达的世界里，被女神宣告了某种惩罚。那就是“无论转世多少次都爱着一个女人，在结合之前死去”。由于无法逃避的转生循环和女神的启示，昭吾流浪于多个世界，开始面对爱……！？
22年前的朱莎娇（薛家燕 饰）是澳门某夜总会的台柱，与港大学生祝展辉相遇后发生了一段情不久便怀孕了，无奈展辉要远赴纽约进修，朱莎娇诞下了女儿祝君好（佘诗曼 饰），此后独自抚养。娇的金兰姐妹文贵芳因不堪男友的抛弃的打击，逼儿子文初（张智霖 饰）喝下了腐蚀性液体，幸好及时发 现才救回了文初的生命，但文初从此变成了哑巴，娇可怜文初，便收养了他。20年后，君好与文初都长大成人了，以兄妹相称之余两人都十分孝顺娇。金胜（唐文龙 饰）是文初的好朋友，胜对文初也十分照顾，每当文受欺负他都挺身而出。君好终于在这时见到了亲生父亲展辉，认识了展辉的爱徒司徒礼信（马浚伟 饰）。礼信非常关心文初是否能医治声带，想尽办法帮忙寻找医生。文初再次遇到了生母，但是在母子相认之后，生母却选择了给文初假地址再次离开。这时，文初与礼信都发现了自己爱上了君好，文初希望君好得到幸福而主动退出了三角关系。文初得到了礼信介绍医生的治疗下能恢复说话的能力后继续与娇生活。而娇为了君好的前程，故意一反常态，希望君好能离开自己…
从美国MIT毕业的黎俊在硅谷工作几年后，融到一大笔资金回国。从小一起长大的顾志忠和容芳高兴地迎接他。容芳在黎俊出国前接受了他的求爱，但容芳在黎俊出国期间变成了顾志忠的女朋友。顾志忠经过努力奋斗，办了一家计算机公司，找到美商MIKE准备合作，研发一种聊天软件。他的网名叫“禾人”，在网上认识了一个叫“风在发端”的网友--小佩。他是滨海大学的校花，小佩在网上聊天认识了名叫“冬瓜糖”的马来西亚网友，冬瓜糖称自己25岁，其实他已60多岁了。女儿唐汉文投身于警察工作。
爱，悲伤，愤怒，厌恶等等，所有的事件都有作为动机的感情。在审讯室里，心野朱梨（饭丰万里江饰）可以看到这些情绪，找出真正的犯人。她有一种特殊的能力，可以用“颜色”来观察人的感情。能看见人的“感情色彩”的古怪女刑警心野朱梨，和感情外露的男刑警风早凉（浅香航大饰）搭档，从看不见的感情逼近不可解的事件的真相。
某天，博学多闻且能看透人事物的主角因涉嫌谋杀而被带到警局所展开的故事。然后，在接受侦讯的过程中，注意到隐藏在案件背后的线索和警探们的担忧。之后，他就经常卷入麻烦中，但他总是以自己的节奏表达他的观点，以解开谜团和人心。
《心冤》将以近5年几宗极之轰动、香港人会记得的案件为重心，虽然是奇案的角度，但会用新的手法去拍，着重犯罪者及执法人员的心理。他强调这部剧很地道，是讲香港的故事。
