小蓝（雨婷儿 饰）的生日快到了，魔仙女王决定送给她一个非常珍贵的音乐盒。魔仙女王告诉小蓝，这个音乐盒里有一枚拥有强大魔力的宝石，这颗宝石能够在关键时刻帮助小蓝、美琪（赵今麦 饰）和美雪（刘黛希 饰）化险为夷。
高梨修辅（豊永利行 配音）是一个无可救药的宅男，在他收藏的众多H漫画和美少女手办中，“妹”，是一个无法回避的主题。作为修辅的妹妹，高梨奈绪（喜多村英梨 配音）居然对这样糟糕的哥哥心怀着满满的好感，为此不惜抓住各种时机有意无意的诱惑着修辅。青梅竹马土浦彩叶（井上麻里奈 配音）的突然出现为兄妹两的关系蒙上了一层阴影，热情主动的彩叶更是让满心嫉妒的奈绪时不时的想要暴走。夹在两个妙龄妹子之间的修辅感到十分头痛，同时，通过种种的蛛丝马迹，他对自己和奈绪的血缘关系产生了怀疑。奈绪的身世里究竟隐藏了怎样的秘密？修辅和奈绪之间的感情能够修成正果吗？这一切都要看修辅的造化了。
1913 年 10 月。日之本是一个因大规模铁路线关闭而导致大部分铁路消失的国家。楠是位于熊本县的大市屋市场。通过以蒸汽机车 8620 及其铁路同伴八六为中心的旅游推广，疲惫不堪的经济得以重建。该城市取得了巨大的成功，并成为铁路修复的圣地。为了进一步增强复苏势头，并促进全国各地铁路运营商和马伊特铁路之间的交流，计划举办第1届Maitetsu节。用于控制铁路车辆运行的人形模块“铁路”也由各自的主人从全国各地集结。受到人类每天举行的会议的启发，女孩们决定也想做点什么。铁道峰会由著名铁路公司铃木站主办。他们聚集在车站前的“Amagiro咖啡厅”，绞尽脑汁想要给Maitetsu祭增添更多的色彩。
故事发生在彩玉大学的理科研究室内，冰室菖蒲（雨宫天 配音）和雪村心夜（内田雄马 配音）是在这里工作的两名研究生。某日，让心夜没有想到的是，自己竟然收到了菖蒲的告白。所为万事以科学为上的理科研究生，对于爱情自然也要用符合逻辑的证据去证伪，为了证明菖蒲对自己的爱确有其事有迹可循，心夜带领着整个实验室开始了对爱的实验。每天都像佣人一样被使唤来使唤去的解说员奏言叶（原奈津子 配音）、性格反复无常，过于以自我为中心的棘田惠那（大森日雅 配音）、表面看来是个不良少年，实际上却是个死宅的犬饲虎辅（福岛润 配音），陪着菖蒲和心夜进行爱情实验的是这些可爱的研究员们。
因为一个神秘男子找到了被称为世界暗之帝王永夜，用他内心最重要的东西为筹码，将他带入2000年以后的未来，一个修仙帝国，为了守护自己曾经失去的最宝贵的东西，永夜面对着诸多修仙强者，不断地展开战斗，走向最强之路。
