虚无，世界最大的灾难。人类只能联合同盟对抗来自虚无的怪物“祝福者”。大陆边境沙洲成为了抵御入侵的重要防线，却有一个名为“祝福之影“的黑暗势力欲寻找被尘封的力量。同盟领袖国度黑岛派出精锐尖兵白狼御伽，意欲摧毁闹事的黑暗势力，却因为一名虚无出来的神秘少女珊瑚的乱入，沙洲变得风起云涌。命运的红线，交织着众人的信念，准备揭开在虚无中隐藏的历史真相。少女与少女超越信念的宿命对决，浪漫奇谭正式展开。
故事讲述平凡的大学生雨宫夕日，某日一只会说话的蜥蜴宣告他被选为拯救世界的骑士。正当夕日对此半信半疑时受到敌人的袭击，并被他应守护的公主朝日奈五月雨拯救，没想到公主却是企图征服世界的魔王。夕日受到五月雨的气概与强大吸引，而成为她忠实的骑士。
神圣世家家主沈鸿图穷匕见，唆使叶宗养子叶寒刺杀叶宗。叶宗中毒性命垂危，所幸有聂离相救。误以为叶宗身死的沈鸿，决心在兽潮后的会议上诬陷聂离等人，借机铲除障碍并一举谋反。而聂离有沈冥和云华执事两位人证在手，神圣世家勾结外敌一事暴露，成为众矢之的。
在太一一行人告别数码世界后，数码世界并没有就此关闭朝向人类的大门，而数码世界的内部却没有太平多少时日，就又开始了纷争。数码世界急需一批被选中的孩子来维护数码世界和人类世界的和平。太一、阿和、素娜等人都已先后成为了初中生，没有太多精力和时间能够和数码宝贝们一起并肩作战，只有阿武和小光成为了新一代的领头人。被选中的孩子有本宫大辅（木内玲子 配音）、井之上京（夏树莉绪 配音）、火田伊织（夏树惠 配音）等人，和他们一同战斗的除了亚古兽、加布兽等，还有新的数码宝贝参与。于是，在第一代数码人的带领下，新的数码宝贝和守护者们开始了同邪恶势力的作战……
吹响！上低音号 第三期制作决定
在异世生存十年的幸存者左天辰去回到了一切悲剧开始的那天； 外星生物入侵，携带细菌...
