主要讲述了喜欢魔术的高中生黑羽快斗，在自己房间内一道隐藏的门后的密室里发现了世界闻名的大盗怪盗基德的服装。之后，身着怪盗基德服装的快斗遇见了父亲——世界知名的魔术家黑羽盗一以前的助手寺井黄之助，从他的口中得知自己的父亲正是怪盗基德，而且他并非死于意外，而是被人暗杀。为了找出杀害父亲的人，快斗决定以第二代怪盗基德的身份开始着手调查父亲真正死因。在以怪盗基德的身份活动的某日，快斗与称呼自己为“黑羽盗一”的神秘组织相遇，而该组织正是他的杀父仇人，故事也由此正式拉开帷幕。
花畑佳子（悠木碧 配音）是一个实实在在的笨蛋。不仅学习力为零，常常收获零分的考卷，在生活中，也是个完全不认路，总是莫名其妙惹出各种各样麻烦的问题人物。可是，佳子虽然脑袋笨，却拥有一颗闪闪发光的善良的内心。阿久津明（杉田智和 配音）和佳子刚好相反，他拥有绝顶聪明的头脑，却不擅长一切和运动有关的事情。是他一直陪伴在佳子身边，照顾着她的学习和生活。温柔迷糊的隅野沙耶香（原田彩枫 配音）是佳子唯一的也是最好的朋友，她的言行举止常常在不知不觉之中被佳子带歪。风纪委员长（上坂堇 配音）苦苦的暗恋着津明，佳子对于她来说，是情敌一般的存在。
何笑然与萧尚麒、陈菲儿是学生时期形影不离的好朋友。何笑然暗恋了萧尚麒八年，也见证了他对陈菲儿的追求，为了友情，她选择将秘密留在心里，却一而再地看到陈菲儿随意对待萧尚麒对她的喜欢。大学毕业前夕的一桩桩事件，让三个人的友情分崩离析。在遭遇爱情与友情的双重背叛后，曾经的“小太阳”何笑然从上海逃到周边城市，成为了一个深夜电台节目的主播。时隔三年，萧尚麒扛着巨大压力来到这座城市经营一家濒临倒闭的四星级酒店，两人带着对彼此的误会和不解在异地他乡重逢，在彼此伤害又相互关心维护的过程中相知相爱。
藤泰弘原作漫画《#枪神#》宣布新作动画《#TRIGUN STAMPEDE#》制作决定！新作由动画公司#Orange#负责制作，2023年启动！
《喜羊羊与灰太狼之奇幻天空岛》是《喜羊羊与灰太狼》系列的第18部作品。是喜羊羊冒险系列《嘻哈闯世界》的第三部作品。
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