与莉可、罗伊以及帕底亚地区的三只最初的宝可梦们一起踏上激动人心的宝可梦世界冒险之旅吧！
舞台是在某个国家的某个地区莫斯特城市。在陈旧大楼的二楼有一家发行《月刊妄想科学》的小出版社。《月刊妄想科学》是一本异想天开，报道“真是吓人一跳！”的事件、即使是科学家也会发出“要不行啦！”声音的超科学现象的科学杂志。工作人员只有帅哥主编兼编辑的塔罗·J·铃木。再加上小学生助手吉罗·田中和狗狗三郎。编辑部一直是空的，塔罗、吉罗和三郎都沉浸在同一栋大楼1F的咖啡馆《岩石（ROCK）》中。有一天，科学家戈洛·佐藤前来咨询，由此开始了一个异想天开的故事……。
上一世，周拙遭逢末日来临，丧尸席卷全球，无数的尸潮向着剩余的幸存者不断发起进攻，没分每秒都有生离死别。周拙奋力抵抗丧尸，却也没能救下家人，最后在遗憾与悔恨中结束了末世的人生。如果有选择，谁会希望自己就算转世还是生活在这恐怖末日之下，连安全需要都无法得到满足，肉体和精神不断受到折磨。然而，周拙对于家人的执念让他无力去思考这些，在灵魂将要脱离肉体之时，恍惚之间有一道声音传来，给了他再活一次的机会。这一世，周拙在末世重生，回到了灾难爆发的两个小时前，保留了记忆和战斗经验的他开始了自己的逆天改命之旅。收集同伴，储备物资，建造据点，集齐胜利的“拼图”！不再心慈手软，不再懦弱犹豫，重生一世，只为化身“家人侠”，保护自己所爱之人！
在一颗名为“赤星”的行星上，人类移民政权天柱会，利用名为“苍寰晶石”的神秘物质，建造了能够改造大气的装置——“浑天”。
