《星学院Ⅲ之潘朵拉秘境》是“星学院”系列的第三部，主要讲述了菲洛、小月、美星三位魔法少女进入潘朵拉奇幻社就职的故事：菲洛和伙伴们通过在星学院的学习，成长为优秀的魔法师，并且即将面临毕业考核。然而这时，她们意外被卷入一场魔卡精灵的失踪事件。与此同时，瑞拉国王突然病重、潘朵拉魔卡风靡一时、王国大臣神秘消失，一切事件的背后似乎埋藏着十年前的一个惊天秘密。为了查明真相，菲洛和伙伴们加入潘朵拉奇幻社，成为极光组的一员。
打工人沈浪惨遭女友背叛，濒死之际竟被地府抢地盘的爷爷“托梦”传承功法。从此白天治病救人，晚上烧纸扎军火、跨界支援爷爷打天下。加特林横扫阴兵，无人机轰炸鬼王，纸扎航母硬刚西方冥界——他凭一己之力垄断阴阳两界军工贸易，收编黑白无常，暴打隐世宗门，甚至反向收购上界财团！
生活在现代的雪女后代冰室君，是个一有情绪波动，就会引发暴风雪并制造出雪人或者雪屋的新社会人。由于他对有些独特但很善良的同事冬月小姐的暗恋之情变得越来越强烈，有时候甚至会将周围冰冻起来。另一方面，被周围人认为很高冷的冬月小姐也对神秘的冰室很感兴趣。
