静电超强力？午饭变酸了！没想到这个世界除了有烦恼星人，还有麻烦分子！麻烦分子比烦恼星人还小，小到肉眼看不见，超迷你战士必须把自己缩小到千分之一，才能进入纳米世界打击新形态的敌人；麻烦分子看起来天真无辜，却能对人类世界造成极大的麻烦，到底它们从何而来，又有什么目的呢？快呼叫超迷你战士，打败你的麻烦！
克莱门汀，前祖拉农十二弟子之一，前漆黑圣典第九席克莱门汀。 虽然对自己的实力有着绝对的自信，但为了躲避某个魔法吟唱者，她却过着逃亡的生活。另一方面，在纳萨力克，他们在安兹的命令下开始收集武道的情报……
高中三年级的冬天。高中生活剩下的时间已经不多。这样下去总有一天会迎来毕业，任谁都是这么想的。
社会在“前所未有的大灾难”的冲击下持续动荡不安。住在东京的青年浅野铃四郎有一个难以启齿的秘密，就是他可以暂停时间的流逝，拥有停止时间的力量。直到有一天，浅野铃四郎遇到了拥有同样超能力的少女桥本荠，并在得知桥本荠的能力被利用于犯罪行为后，冲动地帮助了身陷囹圄的她……
洛云霄穿越到了玄幻世界，被正道人士派往万魔宗做卧底。十年前，他被老宗主收为徒弟，就在前不久老宗主过世了，而他这个亲传弟子自然就顺理成章的成了宗门的继承人。洛云霄知道，他们之所以推选他故宗主，不过是想让他当替死鬼，幸好在关键时刻，他激活了系统，有了系统的帮助，他将万魔宗打造成了最强宗门。
四谷友助（上村祐翔 配音）是一名中学三年级的男生，在班上友助属于默默无闻的那类学生，他既不喜欢结交朋友，在课业上也平平无奇，总是独来独往。一天放学后，友助在意外中穿越到了异世界，让友助震惊的是，他在这里竟然遇见了同班同学新堂衣宇（久保田梨沙 配音）和箱崎红末（和气杏未 配音），她们一个是班级里人气极高的美少女，另一个则体弱多病，总是在病假中。然而，在这个世界里，他们三人是并肩作战的伙伴。
