疼爱独生女零花的微不足道上班族‧鸟栖哲雄，某天因为工作关系和开始一个人生活的零花相约见面，却发现她脸上有被殴打的痕迹。在回家的路上，哲雄看见了像是犯人的男人，并尾随在其後。隔天偷偷回到女儿的公寓，结果却发生了使整个家庭的命运为之一变的事件。父亲为了女儿、为了家庭，走上了修罗之道。高潮迭起的悬疑故事开幕。
百集动画片《孔子》投资近5000万元，起用了强大的幕后创作团队。国学大师季羡林生前曾担任动画片的总顾问并亲自题写片名。剧本前半部分主要由张艺谋御用“金牌编剧”李冯负责，后半部分由著名作家叶兆言执笔，最后再由山东省作协主席张炜统筹全稿，并填写了动画片的主题曲《我是你的芬芳》和《永远的怀念》。央视主持人刘纯燕担任了动画片的配音导演，还在片中为孔子的“红颜知己”兰花配音。孔子后人、著名音乐家孔祥东为动画片谱曲，国画家范曾在动画片的人物设计方面也给予了许多指导。
父亲每晚都会来到母亲棺木旁静坐，直至四十九日后，棺中传来婴孩啼哭。他小心开启，见我是个女婴，此后我便成为东楚备受呵护的小公主。及笄之年，父亲送我入宫，由我自主选择未来的伴侣。皇上与我皆知，我的选择将影响王位归属。正当我在皇上手中写下心意时，太子忽然上前跪禀，表明对公主只有兄妹之情，若定要成婚，则需予另一位女子同等的名分。我望着太子，心中了然，便轻轻点头，成全了他的心意。
故事发生在灵山，这里聚集着一群地界“没有希望”的人们。他们大多数穷凶极恶，被社会抛弃在灵山占地为王，第四代魁拔迷麟诞生于此。天界苦苦找寻魁拔无果，为了消灭魁拔，决心将灵山轰为平地。迷麟从困境中崛起，他的精神也一步步唤醒了灵山众人有血有肉的灵魂。迷麟率领灵山军横扫地界各国，与天为敌，成为一代君临天下的霸主。
邪恶头目吞天派遣手下混沌入侵地球，夺取盘古之力。地球最后的守护者——巨神守卫登场迎战却受重伤，临危之际，巨神守卫把自己的力量赋予五位面对危难依然勇于助人的少年。 混沌虽伤重败退，却在吞天的帮助下获得蛮兽卡。东山再起的混沌回到地球，通过引诱拥有负面情绪的人类，让其与蛮兽卡结合变成强大的蛮兽为己所用。虽然吞天一伙看似不可战胜，但少年们组成的巨神战击队坚信自己能挑战不可能，驾驶各具威力的机兽与邪恶力量抗争到底。
