基因石能量渐渐恢复成基因石，且显露出更强大的力量、更多不为人知的秘密。反派势必不会轻易罢休，将以更强大的姿态卷土重来。但在艰难的挑战中，普力士等人仍看到了希望：宇宙中，分散著为数不明的「变形联盟战士」，这群代表正义的首领勇士若聚集起来，将会成为一股巨流，一起勇敢地为守护地球而战！
本剧讲述了五位量子战队少年卢修、凯拉、杰名、欧泽、齐嘟嘟通过量子隧道穿梭在地球和恐龙世界，接受挑战，守护恐龙和维护两个世界的秩序的故事。他们面临的对手是企图控制两个世界的司徒影和他新的手下威烈团队。幸好，紫露改邪归正，与量子战队并肩作战，全力帮助他们阻止司徒影获取控制两个世界的量子核心。量子战队依然通过神秘的量子力和各种高科技的任务装备，奋力保护着恐龙等野生动物，也奋力保护着两个美丽的世界。
道宗一脉相承，分为四派即青龙、白虎、玄武、朱雀。四派相约共守天下。不料玄武欲霸武林，用美人计挑唆四派互相攻伐。青龙告急，却引出一个惊天大阴谋！执明国国王正因为玄武国的召集令的人选而困扰，女主作为本国公主主动为父分担，在挑选人选的途中遇到了躺睡街头的男主......
斯派罗试图证明自己像其他 Skylanders 一样拥有超能力，但当他们陷入危险境地时才意识到自己的力量。
