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1963年，在冷战太空竞赛中，美国政府秘密发射了升天号（Ascension）太空飞船，携带着一百名男女老少，完成一项世纪航行：寻找新世界，保存人类生命火种。这段旅程期初一切顺利，但很快就陷入了巨大的危机之……
当一名当地十几岁的男孩的尸体被发现在拖拉机的轮子下时，这个偏远社区的村民和他的朋友们被迫敞开心扉，看着他们的秘密被揭露。
故事的主人公是在急诊科工作的医生——红野真空。真空曾在东京的一家大医院的急诊科工作，她怀抱着梦想和自豪感积极乐观地工作。但偶然有一天却发现自己患上了疑难杂症，没有钱治病又不愿放弃工作的她在机缘巧合之下，得知了位于深山里的一个小村庄——虹之村。碰巧虹之村诊所正在招聘内科医生，于是她便隐藏了病情前往小村庄的诊所工作。她乘坐奇怪的巴士，穿过郁郁葱葱的森林，好不容易到达了虹之村，等待着她的竟然是同样来自东京的怪咖外科男医生和认真勤劳的男护士，真空与他们生活在同一屋檐下。此外，真空也在这个村子里认识了一群宛如妖怪般个性鲜明的村民，她在与他们一同欢笑、哭泣、吵架拌嘴的同时，以积极热情的姿态面对病痛，面对生命的成长，在虹之村诊所开启了全新的生活。
