《康熙微服私访记3》沿袭前两部借古讽今、针贬时弊的新派古装轻喜剧作品风格，分为“锦袍记”、“食盒记”和“铃铛记”三个单元故事组成。“锦袍记”中康熙（张国立饰）派大太监三德子（赵亮饰）回故里调查贪官一事，然而当牵扯进亲情之后事情开始变得难以取舍；“食盒记”由宜妃（邓婕饰）的亲戚噶礼送的食盒引发；而在“铃铛记”中，康熙竟然独身离宫，当起了普通老百姓。
一心守护邻里的街头少女兰澈意外卷入一起凶案，与大理寺正卿楼明夜相识，毫不相同的两人在一开始的碰撞中误会连连，但随着彼此的深入了解，两人解除误会，通力 合作，屡破奇案。同时在破案过程中，两人逐渐建立情感、确认对方身份，最终收获了真挚爱情。而兰澈在楼明夜的陪伴与帮助下，经过层层磨炼，一路从街头少女成长为大理寺第一任女少卿，实现了自己的人生理想。
外出打工寻找走失哥哥的少女何晓雪误入传销组织，在与歹徒殊死搏斗后终于逃脱险境。在躲避传销组织追捕的过程中，何晓雪假扮成走失多年的倪盼盼来到倪家， 却无意间掀开了几桩尘封多年的旧案及一直潜藏在倪家表面和平之下的一个巨大阴谋。
张凯铭（何晟铭 饰）和萧玲珑（王黎雯 饰）是一对80后年轻夫妻，他们对爱情充满憧憬。对于他们来说，婚姻不仅仅是感情的事，更是一种“精诚合作”，将物质视作合作的产物，如果合作结束，就按照各自的投入分割财产。因此，他们在结婚之前就签订了婚前协议，过着彼此尊重的“AA制”生活。然而，他们忽视了爱情需要坚持，生活需要耐心这一点。高寒（于和伟 饰）和杨小庭（王琳 饰）是一对走入“七年之痒”的夫妻。他们的婚姻生活面临着平淡和瓶颈，但共同创业积累的财产和婚前协议将他们捆绑在一起。婚前协议关乎情感忠诚，但在财产分割的现实面前，他们面临着冷冰冰的选择。一场关于“情感与金钱”的阴谋正在酝酿，而他们的心是赌注。萧雨海和初征代表了当下年轻人的观念，他们将爱情看作相互取暖的港湾，而婚姻则是改变生存状态的“捷径”。因此，他们不相信爱情，不敢直面内心，也没有勇气去面对婚姻。然而，当他们通过努力得到了想要的名利时，却发现生活的变化远远超出了他们的想象和控制范围。
人过中年的女扳道工刘小站（江珊 饰）原本拥有幸福美满的家庭，但在丈夫冯国强（韩青 饰）的事业蒸蒸日上之际，她在家中遭遇“被下岗”的命运。冯与公司下属孙媛媛有染（石林 饰），转而以感情不和为名提出离婚。虽然得到不菲的抚恤金，可刘小站几乎还是净身出户离开了善良的公婆以及可爱的儿子。此后不久，国强迎娶媛媛，迫使儿子冯鑫在婚礼当天引出一场闹剧。小站也借此机缘结识了胆小嘴碎的出租车司机周勇（周小斌 饰）。周生活拮据，上有老母下有女儿，可是性格十分乐观。他和小站从最初斗嘴相厌，再到惺惺相惜，慢慢走到了一起。
讲述北周一代贤臣独孤信幼女独孤伽罗，凭着自己的聪慧和毅力，一直顽强地生活在乱世之中，与杨坚的感情，从一开始的政治婚姻，渐渐演变到后来的两心相知，伉俪情深的两人最终共同联手，统一了全国，成为了大隋的开国帝后。
姐姐失踪，留下了一个儿子由妹妹孟初夏（李菲儿 饰）抚养，因为带着这个“拖油瓶”，温柔善良的孟初夏从来都与浪漫的爱情无缘。沈岸（朴海镇 饰）是沈氏集团的接班人，过去痛苦的感情经历让他决定通过相亲来寻找完美的结婚对象，由此结识了初夏的好友何若男（屈菁菁 饰）。没想到，何若男在一场车祸中不幸去世，临终前，她将好友初夏托付给了沈岸。然而，坚强自立的初夏不愿意接受沈岸的施舍，与此同时，沈岸的母亲亦对初夏心存偏见。为了对抗强势的母亲，沈岸决定与初夏结婚，可是就在这个节骨眼上，初夏却发现沈岸曾经的恋人正是自己的姐姐。而此时，失踪十年的姐姐忽然现身，一段复杂纠葛的恋情拉开了序幕。
江湖纷争，麻烦不断。神剑山庄的三少爷谢晓峰（何中华 饰）和慕容世家的独女慕容秋荻（俞飞鸿 饰）在百般波折之下，终于迎来了二人要大喜的日子。可大婚当天，谢晓峰却不得不与夺命十三剑——燕十三（王冰 饰）进行一场比试，而这时意外发生，谢晓峰被他的兄弟铁铉之妻吕香华带走。而这背后竟牵扯到攸关国家生死存亡的大事。燕王朱棣发生兵变，为了保护太子朱文奎的出逃，无奈之举下，谢晓峰答应了铁铉的请求，把他们一家杀死，让太子得以出逃。可这真相外人却不知，于是，谢晓峰背下了天下的骂名，被逐出家门，也和慕容秋荻分散。他们的孩子在凄凉中诞生，这样兜兜转转数十年，一切阴谋与真相到了不得不揭晓的时刻……
