《康熙微服私访记3》沿袭前两部借古讽今、针贬时弊的新派古装轻喜剧作品风格，分为“锦袍记”、“食盒记”和“铃铛记”三个单元故事组成。“锦袍记”中康熙（张国立饰）派大太监三德子（赵亮饰）回故里调查贪官一事，然而当牵扯进亲情之后事情开始变得难以取舍；“食盒记”由宜妃（邓婕饰）的亲戚噶礼送的食盒引发；而在“铃铛记”中，康熙竟然独身离宫，当起了普通老百姓。
佐藤爱（小芝风花 饰）从小就是班上的众星捧月的焦点，拥有漂亮可爱的外表，头脑又聪明的她，被所有人都认定了会有美好的未来。然而事与愿违，不知道为什么，随着时间的流逝，小爱越来越平凡，并且最终成为了一无是处的女孩，在28岁这一天，小爱惨遭解雇，彻底沦为无业游民。
这一天，小爱意外的接到了一封短信，发信息的是小爱从前的同班同学长谷部宗介（中岛健人 饰），小时候的宗介呆呆傻傻的，经常被人欺负，只有小爱喜欢他，两人之间有过一段懵懂的初恋。如今，宗介从国外学成归来，竟然蜕变成为了精英高富帅。宗介提出想要和小爱见一面，但小爱又怎么能够让宗介看到如此不堪的自己呢？
“光”酒店的小姐们试图找出杀死姊妹的凶手，秘密和谎言也随之浮出水面。
抗日战争时期，新四军太湖游击纵队，发扬中华民族顽强不屈的精神，同敌人展开了争锋相对的斗争。在司令员薛宏晖的领导下，侦察科长秦天刚和情报员关竹青智取了日军总部的作战密件，游击纵队袭击了苏州浒墅关火车站，炸毁了日军上海虹桥军用机场，爆破了日军的军用仓库，铲除了铁杆汉奸卖国贼，争取了伪军主力团的起义，并获得了太湖冲山岛保卫战大捷。一次又一次的激战，重创了日伪军的有生力量，彻底粉碎了日军对江南地区的第二次清乡计划。江南新四军不但牵制了抗日战争正面战场上日伪军的大批军力，而且似一把锋利的匕首，牢牢地插在敌人的心脏里。
“镀金时代”是经济发生巨大变革的一段时期，是大量财富被创造也被损失的一段时期，还是名门新贵激烈竞争的一段时期。
香港SARS疫潮过后，人们终于从阴霾中走出来。脑外科医生程至美突然得知前女友的死讯，情绪崩溃，极度自责抑郁。法医岑雅晴伴其左右，鼓励他重新建立信心。急症室医生黎国柱结束了与女友的恋情，却卷入与骨科医生叶淘及见习医生曾淑淇的三角恋中。不幸感染SARS的心脏科医生林敏智留下后遗症，为保全名声而隐瞒病情，却令病情日益恶化。妇产科医生万安生与急症科医生向众仁正计划共同生活，然而却因护士戴玉莹的介入而面临一场情感考验。
带着一点希望和绝望不已的心情，珍开始踏上找寻超能力的旅程。
