阎王宝藏一案之后，梅雨墨继承帝位，白雪晴逃离了京城。几年过去，阳城爆发瘟疫，蔓延至京城，梅雨墨带上佟安出宫微服私访，二人身陷黑店之际，被一日本女孩晴明所救。另一边，白雪晴同秦三川进京调查瘟疫的原因。机缘巧合之下，白雪晴与梅雨墨匆匆相遇......此时皇城深宫中，权倾朝野的六贝勒与仁贵妃似乎又有着不可告人的预谋。风雨欲来，随着帝国主义势力的渗透，大清江山摇摇欲坠......
这两位五年级的住院医生在新的一年的第一天返院，这一年将决定他们的职业生涯：梅雷迪斯因干预德里克的临床试验而面临后果，并被医院解雇；西雅图市中心发生巨大天坑事件后，艾普瑞尔试图承担起住院总医师的职责；克里斯蒂娜和欧文仍然因对未出生的孩子截然不同的感情而争吵不休。
新一季中，莱特曼集团的经营似乎陷入最困难的时期，集团与FBI的长期合作宣告终止，卡尔·莱特曼博士（蒂姆·罗素 Tim Roth 饰）签约的新书迟迟未能完成，面临对簿公堂的窘境，而这位拥有极高才华的天才博士和家人、同事之间的关系也变得颇为复杂。他与女儿艾米莉（海莉·麦可法兰德 Hayley McFarland 饰）相互依存，女儿有时会反抗父亲的强势，扮演着母亲的角色；他和吉莉安·福斯特（凯利·威廉姆斯 Kelli Williams 饰）的关系暧昧不清，相互试探，又颇显紧张。与此同时，各种各样棘手案件纷至沓来，银行抢劫案、文物展览会盗窃案、矿井爆炸案、宗教团体事件……无一不对莱特曼提出最严峻和最危险的考验。
