在与世界隔绝的博尼湾岛上，天才少女小珍与她的冒险家爷爷和一群恐龙们一起和睦的生活在这里，建造了最尖端的城市“恐龙小镇”。可是在恐龙小镇上其实还生活着另一个人，那就是坏蛋科学家阿麦。他为了捉到恐
聪明活泼的逗逗、迪迪希望能够成为帮助村民解决各种问题的酷比侦探。爷爷告诉他们：要成为真正的酷比侦探，必须通过重重考验，集齐100枚酷比徽章。他们接到村民们的求救：甜甜无故失踪、考拉的蛋糕被偷、阳光森林出现怪物。为了帮助村民，他们勇敢地开始了一系列充满冒险、趣味十足的“侦探之旅”。通过细心观察、层层推理，他们最终为村民们解决了一个又一个的难题，如愿获得酷比徽章。
喜欢天空，喜欢摄影的普通高中生森宫依人（冈本信彦 配音）和体弱的姐姐森工苍乃（中原麻衣 配音）相依为命。在一次拍摄天空的过程中，依人和命定的少女四方茉莉（能登麻美子 配音）相遇，这个活泼开朗的女孩让依人很有好感。因为一些意外，茉莉住进了依人的家，和依人的同学石月真名（本多阳子 配音）等也成为了好友。恰巧的是，真名的妹妹小依（清水爱 配音）和依人的姐姐苍乃住在同一家医院。于是，依人和真名等的联系更加紧密了。随后出现的一些事件，让依人认识到原来茉莉是传说中的“夜娲人”，拥有超强能力和不死之身，而许多事情的真相依人却还不知晓……
