西历5012年。突然入侵地球的＜外星人＞与其制造的＜机械生物＞导致人类面临灭亡危机。仅存的人类逃至月球，为了夺回地球，利用＜人造人＞士兵展开反攻作战。然而无限增加的＜机械生物＞阻挡在前，战争陷入胶著状态。作为最终兵器，人类派遣新型人造人＜寄叶＞部队至地球。刚被派往地球的＜2B＞与先行调查员＜9S＞会合，一同执行任务，却在途中遇见许多神秘难解的现象……。这是关于为人类而战，无生命＜人造人＞的故事－－ PS：Automata指的是“自动人形”，别再机械纪元求求了
故事发生在静冈县沼津市海边的小镇、位於内浦的私立浦之星女子学院。在这间骏河湾一隅的小小高中里面，以2年级的高海千歌为中心的9名少女，怀抱著远大的梦想挺身而出。那就是，要成为闪闪发光的“学园偶像”！只要努力不懈梦想一定会实现──。现在只需要朝著那闪耀的目标，奋不顾身地勇往 直前就行了！ 从此，少女们“ 大家一起实现的故事”（学园偶像计划）就此展开！
两名青少年表面上是在一家游戏商店工作，而他们的实际工作则是追捕闯入现实世界的电子游戏怪物。
曾经是最强机龙使的路克斯因为从来不主动攻击别人而获得了“最弱无败”的称号。5年前，他见证了因革命而亡国的一幕。然而，当他阴差阳错地闯入的女子宿舍澡堂之后，意外地邂逅了新王国的公主莉姿夏尔蒂，后来又莫名其妙地进入了培育机龙使的女子学园就读，最弱的王子的后宫战斗物语就此展开。
跟着墨菲家的脚步，回到那个孩子们恣意游荡，纵情畅饮啤酒，男人和电视形影不离的 1970 年代。
