在《宇宙小子》的世界里，由一组宝石战士保护宇宙免遭邪恶力量的威胁。主人公小男孩史蒂文·宇宙继承了母亲的宝石力量，与其他三位宝石战士石榴、珍珠、紫晶一起生活。剧集围绕他们展开，讲述了史蒂文和三位宝石战士姐姐一起，在日常生活中拯救世界，以及探索自身神奇能力的成长故事。
故事发生在一座民风淳朴风景秀美的小镇之中，曾经，天空上出现的巨大黑色圆盘令人们陷入了恐慌之中，但除此之外大家的生活却并未受到实质性的影响，世界依旧在照常运转着，久而久之，人们渐渐习惯了被圆盘笼罩的生活。
在古老而神秘的喵星球上，有一种神奇强大的能量，它能释放各种能量精灵，为了防止这种强大的力量被坏人利用，喵能战士肩负守护喵星能量，维护宇宙和平的重任。“精灵宝匣”是召唤和收服能量精灵的神器，然而精灵宝匣被盗，能量精灵四处破坏，地球陷入空前危机，喵能战士即刻出击！
沈剑心为了解救清水岛村民，返回中原寻找解药。江湖外早已失去平静，偏安一隅的五圣教屡遭加害，破败的枫华谷村庄莫名异动，身处其中的沈剑心又会面临怎样的危机……
