该系列的舞台是以纽约为蓝本的市中心。 布莱斯特和她的父亲进入了一间小小宠物店，这是一所面向各种宠物来营业的繁华都市中的公寓。当她开始真正的冒险时，她发现她能奇迹般的理解所有的宠物。一路上，她和宠物们一起去冒险，可是宠物店确面临要倒闭的危险，由一个宠物店的Biskit来接管，驱动它的业务。别无选择，宠物求助布莱斯帮助他们以挽救宠物店。
主人公逸徇受父命前往上石郡，意欲收复政权，铲除清理当地掌权机关“玄天司”首领——葛覃。不料方到上石郡逸徇却倍受到冷遇，葛覃尽显地头蛇风范，逸徇第一战出师不利。恰逢此时少女十一月前来行刺葛覃。逸徇顺势借此事件还以玄天司众部颜色，宣告自己的主权。但十一月行刺未果遇险，逸徇好意救下十一月，不料却反被十一月绑至小树林。二人暗中交谈，逸徇从十一月口中了解到古族的往事，意识到可以利用古族之力与玄天司对抗，于是替十一月解毒，打算招募她为自己所用。不料玄天司黍离带领追兵包围小树林，二人陷入险境，葛覃也于此时现身。葛覃强行要带走十一月，不惜与逸徇爆发冲突，两伙人在树林大战。战斗中逸徇无意间触发自己古族的血脉，复刻了十一月的图腾，并且借助其灵力，带领重伤的十一月一起脱逃。
三年前的那场事故 使得凉宫遥以及鸣海孝之的人生发生了巨大的变化。
