四大宗门之首的玄灵宗，多年来第一次来临水城选拔弟子，方秦两家围绕这一个将决定二者命运的契机，展开明争暗斗。最终，秦南依靠潜心修炼、绝佳天资以及奇遇所得的战神之魂，在使者萧轻雪的公正判罚下，成功扭转颓势战胜方家。进入宗门后，秦南因卷入萧轻雪被逼婚一事，惹来宗主之子欧阳君的仇视。为了不断变强，报答萧轻雪的知遇之恩，秦南屡破强敌，连夺万象大比、外门大比第一、与四大宗门天才共闯武缘阁，并获得搅动大陆的惊天秘密，与冷锋约战生死殿、破北海家围困临水城之难，探索九字真言塔，誓与宗门恶势力战斗到底。
生活在现实世界的四个孩子，一道魔幻之门，一个故事世界——托比、尼克、杰茜卡、卢卡斯，在另一个时空——高米岛的冒险之旅。命运谷是个充满愉悦的小镇，不信，问问尼克和托比两兄弟和他们的朋友杰茜卡和卢卡斯就知道了。 这四个普普通通的小孩，过着快乐的日子，但是他们有一个大秘密：穿过厨房的储藏室，向下走过几道石阶，就可以到达一个秘密基地。秘密基地是通向神秘时空高米岛的中央控制室，那儿有一道通往高米岛的魔幻之门，还有许多魔法卷轴，可以观察高米岛战况的窗户，以及控制他们能量的水晶和水晶球。当伙伴们通过魔幻之门后，总有一个小伙伴作为自然之王守护者留在秘密基地，协助其他人战斗。一旦进入高米岛，各个元素水晶球就会充满力量，他们就能化身为自然之王，成为超级英雄高米迪。
怀揣着对生命的留恋，主角在临终之际将数据传输到游戏世界，成为了等级为1的NPC。然而好景不长，一场“BUG”席卷了游戏内部。目睹身边的NPC接连消逝，手握最后一次生命线的主角决定奋起抗争……
该剧集延续上一部《金光御九界之墨武侠锋》，讲述了墨乱祸世，九界濒危，墨家九算野心逐一浮现，俏如来等人如何一阻墨乱；另一边，佛门变劫再临，紫金钵之秘将揭开千年圣战，九界之一的佛界天门与地门之间再起冲突！
