本季中邪恶的女王曼多拉将孔雀和罗丽抓回仙境，为救出同伴，各位主角将再次闯入仙境。女王控制的仙境更加危险，能否救出同伴我们还将拭目以待。本季中全新角色琪娜将会登场，她拥有神秘娃娃菲灵，并有着独特的战斗技能。她能否击败水王子和封银沙阻止邪恶女王的计划吗？
汉朝末年，董卓挟天子以令诸侯，战神吕布为其征讨，四方群雄并起。而大势决断，竟尽出一家之手，水镜门下八奇，谋冠天下。就在此时，一个神秘的刺客跟随他的商家主人悄然走进这个时代，牵出群英纷争，乱世无常……
上一世，周拙遭逢末日来临，丧尸席卷全球，无数的尸潮向着剩余的幸存者不断发起进攻，没分每秒都有生离死别。周拙奋力抵抗丧尸，却也没能救下家人，最后在遗憾与悔恨中结束了末世的人生。如果有选择，谁会希望自己就算转世还是生活在这恐怖末日之下，连安全需要都无法得到满足，肉体和精神不断受到折磨。然而，周拙对于家人的执念让他无力去思考这些，在灵魂将要脱离肉体之时，恍惚之间有一道声音传来，给了他再活一次的机会。这一世，周拙在末世重生，回到了灾难爆发的两个小时前，保留了记忆和战斗经验的他开始了自己的逆天改命之旅。收集同伴，储备物资，建造据点，集齐胜利的“拼图”！不再心慈手软，不再懦弱犹豫，重生一世，只为化身“家人侠”，保护自己所爱之人！
故事发生在大名鼎鼎的绫薙学园之中，这里是孕育音乐艺能界新星的温床。在所有学科之中，“音乐学科”位居金字塔的上层，而由三年级顶级生所组成的“华樱会”更是学生们可望不可及的神圣存在，传说，被华樱会的首领凤树（诹访部顺一 配音）所选中的人，将会接收他的“特别指导”，送往无可估量的前途。初来乍到的新人星谷悠太（花江夏树 配音）、容易害羞怯场的那雪透（小野贤章 配音）、资质优异却容易冲动的月皇海斗（朗斯贝里·亚瑟 配音）、沉默寡言容易被人误解的天花寺翔（细谷佳正 配音）、心地善良外冷内热的空闲愁（前野智昭 配音），他们虽然拥有着无限的潜力，却因为各自的种种而成为了落选者，凤树的出现改变了他们的命运。
在太一一行人告别数码世界后，数码世界并没有就此关闭朝向人类的大门，而数码世界的内部却没有太平多少时日，就又开始了纷争。数码世界急需一批被选中的孩子来维护数码世界和人类世界的和平。太一、阿和、素娜等人都已先后成为了初中生，没有太多精力和时间能够和数码宝贝们一起并肩作战，只有阿武和小光成为了新一代的领头人。被选中的孩子有本宫大辅（木内玲子 配音）、井之上京（夏树莉绪 配音）、火田伊织（夏树惠 配音）等人，和他们一同战斗的除了亚古兽、加布兽等，还有新的数码宝贝参与。于是，在第一代数码人的带领下，新的数码宝贝和守护者们开始了同邪恶势力的作战……
故事描述的是在人间与阴间的交界处，八百万的神明和服侍他们的死灵——神器，以及被称为妖的魑魅魍魉一同生活着。 可爱的女中学生在那儿遇到了居无定所、没有工作、自称是“神”的穿着运动衫的人。 像这样一个性格粗心大意、性情不定，而且不能很好地听祈愿、没有人知道的神明却有一个能力，那就是将此岸与彼岸以及其夹缝——世上各种琐碎的东西斩断。 看点：流浪神差归来！5日元准备好了吗? 第一季后期进行了原创制作，而原本应该播放的毘沙门篇将在这期放送。新人物也将登场，夜斗与日和是否能够战胜即将到来的各种挑战呢？拭目以待吧......
