4年了，距离那场私人武装组织——天人与人类联盟军的决战过去4年了。
姜小勇在末世中被绿茶女背叛致死，意外复活到了一年前并获得盲盒系统，他处处先人一步，在末世降临前搜集物资豪掷千金打造安全屋，通过系统不断变强，复仇前世敌人，从此走上了逆袭巅峰的王者之路。
与七大不可思议中的第七号、“厕所的花子”中的花子君结下不解之缘的少女：八寻宁宁。驱魔师一族的少年：源光。两人与花子君一起，为了将发生异变的七大不可思议以及怪异的传闻恢复原状，每日奔忙不停。忽一日，花子君说道：七大不可思议中出了背叛者。宁宁等人为了找出背叛者，开始逐一摧毁七大不可思议的依附物。他们已经摧毁了第二号“岬的楼梯”以及第五号“16时的书库”，剩下包括“厕所的花子”在内的五个…而在暗中，花子君的弟弟司，召集了七峰樱、日向夏彦、以及新成为七大不可思议第三号“镜地狱”的三叶，接近了宁宁等人尚未找到的七大不可思议……
怕踢学院进入新世纪，处处充满了神奇的色彩，千奇百怪的奇遇和经历，小衰衰出人意料的表示：“每次都是你们几个人，太没意思了，我要交新朋友！”同期出演的金老师、大脸妹、庄酷、小金等人不！认！账！小伙伴的情谊怎么可能说没就没了，看来小衰衰对大家的认识还不够深刻，因此——众人要让阿衰有个深刻的认识和交流！嘻嘻嘻~世界上有千万朵，但唯有一直是独特的你！奇幻之旅中主角担当阿衰将给我们带来什么样的爆笑故事，好戏不要错过！
在太一一行人告别数码世界后，数码世界并没有就此关闭朝向人类的大门，而数码世界的内部却没有太平多少时日，就又开始了纷争。数码世界急需一批被选中的孩子来维护数码世界和人类世界的和平。太一、阿和、素娜等人都已先后成为了初中生，没有太多精力和时间能够和数码宝贝们一起并肩作战，只有阿武和小光成为了新一代的领头人。被选中的孩子有本宫大辅（木内玲子 配音）、井之上京（夏树莉绪 配音）、火田伊织（夏树惠 配音）等人，和他们一同战斗的除了亚古兽、加布兽等，还有新的数码宝贝参与。于是，在第一代数码人的带领下，新的数码宝贝和守护者们开始了同邪恶势力的作战……
曾经，世界面临着被称为「邪龙」的邪恶存在所毁灭。
